LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

YNL147W, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, LSM7

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:17.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:58.80 動脈:60 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:18.20 脾臓:56.70 胸腺:12.90 骨髄:39.40 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:7.17 小脳:6.86 脳幹:7.48 脳梁:7.06 松果体:- 末梢神経:7.33 脊柱:7.26 網膜:- 目:- 動脈:7.61 静脈:7.20 リンパ節:8.10 末梢血:- 脾臓:7.95 胸腺:8.52 骨髄:7.68 脂肪:7.26 骨:- 皮膚:7.96
CAGE 大脳:2.84 小脳:- 脳幹:2.59 脳梁:2.55 松果体:2.96 末梢神経:- 脊柱:2.96 網膜:- 目:- 動脈:2.59 静脈:2.93 リンパ節:2.91 末梢血:- 脾臓:2.76 胸腺:2.70 骨髄:- 脂肪:2.14 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.11 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.22 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:5.06 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:3.60 前立腺:56.30 卵巣:37.30 精巣:8.70 心臓:51.10 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:42.40     肝臓:52.80        肺:24.40    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:53.30 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.12 胎盤:7.68 前立腺:8.14 卵巣:8.27 精巣:7.77 心臓:7.02 骨格筋:6.57 食道:7.85 胃:7.49 腸:7.65 結腸:8.09 肝臓:6.97 肺:7.42 膀胱:- 腎臓:7.18 下垂体:7.90 甲状腺:7.45 副腎:6.99 膵臓:7.13 乳腺:7.64 唾液腺:7.17
CAGE 子宮:2.67 胎盤:2.75 前立腺:2.63 卵巣:2.50 精巣:2.58 心臓:2.44 骨格筋:2.67 食道:2.83 胃:- 腸:2.73 結腸:2.73     肝臓:2.45    肺:2.47 膀胱:2.47 腎臓:2.38 下垂体:3.27 甲状腺:2.66 副腎:- 膵臓:2.76 乳腺:2.95 唾液腺:2.50
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.01 卵巣:5.83 精巣:5.99 心臓:3.40 骨格筋:4.21 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:5.18     肝臓:3.72        肺:4.60    膀胱:- 腎臓:4.59 下垂体:- 甲状腺:5.31 副腎:6.30 膵臓:- 乳腺:5.02 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016199
Gene ID 51690
Unigene ID Hs.512610
Probe set ID 204559_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000130332
GTEx ID ENSG00000130332

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_025349
ラット[1]  NM_001108732

染色体

19p13.3  [2,321,522  -  2,328,614]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type
IPR017132  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10523320
10851237
11591653
11920408
12165861
12477932
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14603251
14667819
15057824
15231747
15452143
15489334
17643375
19615732
21890473
21906983
21988832
22365833
22939629
23000965
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0016070  RNA metabolic process

Cellular Component

GO:0005829  cytosol
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0017070  U6 snRNA binding