RAB23, member RAS oncogene family

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同義遺伝子名

RAB23, HSPC137, Ras-related protein Rab-23, DKFZp781H0695, RAB23, member RAS oncogene family, MGC8900

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:17.80 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:329.70 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:51.20 皮膚:19.20
GeneChip 大脳:4.40 小脳:4.54 脳幹:4.39 脳梁:4.60 松果体:- 末梢神経:4.80 脊柱:4.86 網膜:- 目:- 動脈:5.24 静脈:5.33 リンパ節:4.08 末梢血:- 脾臓:4.09 胸腺:4.26 骨髄:4.45 脂肪:4.61 骨:- 皮膚:4.41
CAGE 大脳:2.63 小脳:- 脳幹:2.62 脳梁:2.75 松果体:2.04 末梢神経:- 脊柱:2.97 網膜:- 目:- 動脈:4.03 静脈:2.27 リンパ節:1.51 末梢血:- 脾臓:1.32 胸腺:1.56 骨髄:- 脂肪:2.52 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.72 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.17 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.73 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:109.40 胎盤:25.50 前立腺:45.10 卵巣:- 精巣:13 心臓:51.10 骨格筋:- 食道:- 胃:42.50 腸:32.40 結腸:-     肝臓:21.10        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.37 胎盤:5.21 前立腺:6.10 卵巣:5.07 精巣:4.20 心臓:4.70 骨格筋:4.34 食道:4.74 胃:5.06 腸:4.85 結腸:4.51 肝臓:4.12 肺:4.41 膀胱:- 腎臓:4.23 下垂体:4.39 甲状腺:4.96 副腎:4.43 膵臓:4.29 乳腺:4.53 唾液腺:4.15
CAGE 子宮:4.18 胎盤:2.90 前立腺:4.25 卵巣:3.10 精巣:2.56 心臓:2.64 骨格筋:2.15 食道:3.29 胃:- 腸:2.62 結腸:3.52     肝臓:1.57    肺:2.49 膀胱:4.84 腎臓:1.81 下垂体:2.34 甲状腺:3.32 副腎:- 膵臓:1.42 乳腺:2.59 唾液腺:1.28
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.80 卵巣:1.37 精巣:1.41 心臓:0.95 骨格筋:1.35 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.77     肝臓:0.29        肺:1.82    膀胱:- 腎臓:1.15 下垂体:- 甲状腺:0.95 副腎:0.61 膵臓:- 乳腺:1.03 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016277
Gene ID 51715
Unigene ID Hs.555016
Probe set ID 220955_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000112210
GTEx ID ENSG00000112210

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_001159729, NM_008999
ラット[1]  NM_001109005, NM_008999

染色体

6p11.2  [57,053,581  -  57,087,078]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002041  Ran GTPase
IPR013753  Ras
IPR001806  Ras GTPase
IPR020849  Ras small GTPase
IPR003579  Ras small GTPase, Rab type
IPR005225  Small GTP-binding protein
IPR020851  Small GTPase
IPR003578  Small GTPase, Rho type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11042152
12477932
12878157
14574404
14612978
14617350
15489334
16344560
17373734
17503333
18485483
18559507
20358613
21139048
21412941
21540310
21890473
21963094
21988832
22365972
22452336
22724020
23007279
23599695
23948406
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000045  autophagic vacuole formation
GO:0006968  cellular defense response
GO:0042733  embryonic digit morphogenesis
GO:0006184  GTP catabolic process
GO:0045861  negative regulation of proteolysis
GO:0042992  negative regulation of transcription factor import into nucleus
GO:0015031  protein transport
GO:0008589  regulation of smoothened signaling pathway
GO:0007264  small GTPase mediated signal transduction
GO:0021513  spinal cord dorsal/ventral patterning

Cellular Component

GO:0005776  autophagic vacuole
GO:0005737  cytoplasm
GO:0010008  endosome membrane
GO:0045335  phagocytic vesicle
GO:0030670  phagocytic vesicle membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005525  GTP binding
GO:0003924  GTPase activity