plectin 1, intermediate filament binding protein 500kDa

同義遺伝子名

EBS1, Plectin-1, PLTN, EBSO, PCN, Hemidesmosomal protein 1, PLEC1b, HD1, intermediate filament binding protein, epidermolysis bullosa simplex 1 (Ogna), PLEC1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:36.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:276

脊柱:1010.70

網膜:-

目:146.90

動脈:-

静脈:133.30

リンパ節:121.30

末梢血:18.20

脾臓:113.40

胸腺:25.80

骨髄:157.40

脂肪:-

骨:64

皮膚:81.60

GeneChip

大脳:5.37

小脳:4.82

脳幹:5.25

脳梁:5.85

松果体:-

末梢神経:6.42

脊柱:6.34

網膜:-

目:-

動脈:5.94

静脈:5.31

リンパ節:5.43

末梢血:-

脾臓:5.10

胸腺:6.18

骨髄:5.63

脂肪:5.77

骨:-

皮膚:5.96

CAGE

大脳:4.11

小脳:-

脳幹:4.02

脳梁:4.34

松果体:3.49

末梢神経:-

脊柱:4.13

網膜:-

目:-

動脈:5.08

静脈:4.48

リンパ節:4.52

末梢血:-

脾臓:4.11

胸腺:4.22

骨髄:-

脂肪:4.66

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.32

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.08

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.92

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:36.50

胎盤:98.40

前立腺:56.30

卵巣:186.30

精巣:30.30

心臓:89.40

骨格筋:221

食道:-

胃:127.50

腸:-

結腸:407

肝臓:-

肺:83.10

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:115.60

乳腺:130.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.52

胎盤:6.01

前立腺:5.95

卵巣:5.50

精巣:5

心臓:5.49

骨格筋:7.14

食道:6.34

胃:5.20

腸:5.68

結腸:5.87

肝臓:4.82

肺:5.50

膀胱:-

腎臓:5.09

下垂体:5.18

甲状腺:4.76

副腎:4.88

膵臓:4.85

乳腺:5.09

唾液腺:5.59

CAGE

子宮:4.64

胎盤:4.70

前立腺:4.34

卵巣:4.48

精巣:3.76

心臓:4.68

骨格筋:5.51

食道:4.82

胃:-

腸:4.76

結腸:4.65

肝臓:3.70

肺:4.49

膀胱:4.43

腎臓:3.84

下垂体:3.24

甲状腺:3.46

副腎:-

膵臓:3.92

乳腺:4.03

唾液腺:4.34

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.74

卵巣:1.67

精巣:1.50

心臓:0.35

骨格筋:0.56

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.70

肝臓:0.24

肺:0.97

膀胱:-

腎臓:0.81

下垂体:-

甲状腺:2.21

副腎:1.19

膵臓:-

乳腺:0.78

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000445
Gene ID	5339
Unigene ID	Hs.434248
Probe set ID	216971_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000178209
GTEx ID	ENSG00000178209

オーソログ対応遺伝子

マウス[30]	NM_001163540, NM_001163542, NM_001163549, NM_001164203, NM_011117, NM_201385, NM_201386, NM_201387, NM_201388, NM_201389, NM_201390, NM_201391, NM_201392, NM_201393, NM_201394
ラット[13]	NM_001164296, NM_001164297, NM_001164298, NM_001164299, NM_001164302, NM_001164303, NM_001164304, NM_001164305, NM_001164307, NM_001164308, NM_022401, NM_201391, NM_201392, NM_201393, NM_201394

染色体

8q24.3 [144,989,321 - 145,050,902]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016146	Calponin-homology
IPR001715	Calponin-like actin-binding
IPR018159	Spectrin/alpha-actinin

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006915	apoptosis
GO:0034329	cell junction assembly
GO:0006921	cell structure disassembly during apoptosis
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0031581	hemidesmosome assembly

Cellular Component

GO:0043034	costamere
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005925	focal adhesion
GO:0030056	hemidesmosome
GO:0045111	intermediate filament cytoskeleton
GO:0005886	plasma membrane
GO:0042383	sarcolemma
GO:0016528	sarcoplasm

Molecular Function

GO:0003779	actin binding
GO:0030506	ankyrin binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008307	structural constituent of muscle

plectin 1, intermediate filament binding protein 500kDa

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function