procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2

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同義遺伝子名

Lysyl hydroxylase 2, procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, PLOD2, LH2, TLH

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:26.10

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:-

目:29.40

動脈:209.80

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:64.40

骨髄:98.40

脂肪:40.30

骨:89.60

皮膚:144

GeneChip

大脳:5.18

小脳:4.66

脳幹:5.14

脳梁:5.90

松果体:-

末梢神経:5.31

脊柱:6.66

網膜:-

目:-

動脈:7.79

静脈:7.73

リンパ節:4.60

末梢血:-

脾臓:4.46

胸腺:5.94

骨髄:3.71

脂肪:7.63

骨:-

皮膚:6

CAGE

大脳:3.30

小脳:-

脳幹:3.46

脳梁:2.95

松果体:3.24

末梢神経:-

脊柱:4.32

網膜:-

目:-

動脈:5.00

静脈:3.36

リンパ節:2.41

末梢血:-

脾臓:2.32

胸腺:3.15

骨髄:-

脂肪:4.98

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.02

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.97

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.65

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:136.70

胎盤:87.40

前立腺:33.80

卵巣:111.80

精巣:17.30

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:32.40

結腸:25.40

肝臓:84.40

肺:44

膀胱:-

腎臓:62.40

下垂体:116

甲状腺:163.70

副腎:101.60

膵臓:106.70

乳腺:46.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.06

胎盤:7.45

前立腺:6.70

卵巣:7.30

精巣:5.33

心臓:6.69

骨格筋:4.06

食道:5.40

胃:6.49

腸:6.41

結腸:5.24

肝臓:7.55

肺:5.55

膀胱:-

腎臓:6.42

下垂体:5.39

甲状腺:8.54

副腎:6.73

膵臓:6.04

乳腺:6.15

唾液腺:5.36

CAGE

子宮:3.65

胎盤:4.42

前立腺:3.77

卵巣:4.18

精巣:3.00

心臓:4.25

骨格筋:2.72

食道:3.73

胃:-

腸:4.55

結腸:4.32

肝臓:5.51

肺:3.47

膀胱:4.45

腎臓:4.03

下垂体:2.93

甲状腺:4.75

副腎:-

膵臓:3.77

乳腺:4.88

唾液腺:2.66

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.54

精巣:2.75

心臓:1.00

骨格筋:1.05

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.46

肝臓:3.63

肺:1.07

膀胱:-

腎臓:4.01

下垂体:-

甲状腺:4.58

副腎:0.10

膵臓:-

乳腺:0.43

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000935
Gene ID	5352
Unigene ID	Hs.477866
Probe set ID	202620_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000152952
GTEx ID	ENSG00000152952

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001142916, NM_011961
ラット[2]	NM_001142915, NM_175869

染色体

3q24 [145,787,227 - 145,881,440]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005123	Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase
IPR006620	Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit

GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0006464	protein modification process
GO:0001666	response to hypoxia

GO:0005783	endoplasmic reticulum
GO:0005789	endoplasmic reticulum membrane
GO:0030867	rough endoplasmic reticulum membrane

GO:0005506	iron ion binding
GO:0031418	L-ascorbic acid binding
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0008475	procollagen-lysine 5-dioxygenase activity

procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function