SRY (sex determining region Y)-box 18

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同義遺伝子名

SOX18, HLTS, Transcription factor SOX-18, SRY (sex determining region Y)-box 18

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:4.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:- 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:3.21 小脳:3.23 脳幹:3.19 脳梁:3.29 松果体:- 末梢神経:3.21 脊柱:3.22 網膜:- 目:- 動脈:3.47 静脈:3.47 リンパ節:3.89 末梢血:- 脾臓:3.92 胸腺:3.28 骨髄:3.34 脂肪:4.69 骨:- 皮膚:3.59
CAGE 大脳:2.71 小脳:- 脳幹:2.43 脳梁:2.76 松果体:2.47 末梢神経:- 脊柱:2.47 網膜:- 目:- 動脈:3.83 静脈:4.80 リンパ節:3.75 末梢血:- 脾臓:3.87 胸腺:2.50 骨髄:- 脂肪:4.59 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.32 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.84 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.13 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:102 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:8.50     肝臓:-        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:17.80 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.52 胎盤:3.41 前立腺:3.17 卵巣:3.44 精巣:3.31 心臓:4.53 骨格筋:3.53 食道:3.63 胃:3.63 腸:3.96 結腸:4.28 肝臓:3.06 肺:4.35 膀胱:- 腎臓:3.93 下垂体:2.95 甲状腺:3.82 副腎:3.53 膵臓:3.48 乳腺:3.86 唾液腺:3.34
CAGE 子宮:4.53 胎盤:3.83 前立腺:3.99 卵巣:3.87 精巣:3.23 心臓:5.01 骨格筋:3.91 食道:4.20 胃:- 腸:3.05 結腸:3.26     肝臓:3.24    肺:4.70 膀胱:3.54 腎臓:3.54 下垂体:2.03 甲状腺:3.76 副腎:- 膵臓:2.71 乳腺:4.77 唾液腺:2.90
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.27 卵巣:2.24 精巣:2.33 心臓:3.01 骨格筋:3.61 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.18     肝臓:1.44        肺:4.21    膀胱:- 腎臓:2.46 下垂体:- 甲状腺:1.59 副腎:4.18 膵臓:- 乳腺:3.75 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018419
Gene ID 54345
Unigene ID Hs.8619
Probe set ID 219568_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000203883
GTEx ID ENSG00000203883

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_009236
ラット[1]  NM_001024781

染色体

20q13.33  [62,679,076  -  62,680,994]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1614875
7665083
10807548
10858556
11130989
11554755
11748221
11780052
12100890
12165811
12194848
12477932
12740761
15489334
16179596
16882943
18065521
18496767
18564920
18564921
21796627
21988832
22018271
22292085
24269235

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001525  angiogenesis
GO:0043534  blood vessel endothelial cell migration
GO:0048469  cell maturation
GO:0035050  embryonic heart tube development
GO:0060956  endocardial cell differentiation
GO:0060214  endocardium formation
GO:0022405  hair cycle process
GO:0001942  hair follicle development
GO:0001947  heart looping
GO:0001701  in utero embryonic development
GO:0001946  lymphangiogenesis
GO:0060836  lymphatic endothelial cell differentiation
GO:0042789  mRNA transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0003151  outflow tract morphogenesis
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0048866  stem cell fate specification
GO:0001944  vasculature development
GO:0001570  vasculogenesis

Cellular Component

GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0044212  DNA regulatory region binding