slingshot homolog 1 (Drosophila)

同義遺伝子名

SSH1L, SSH-1, FLJ38102, SSH-1L, slingshot homolog 1 (Drosophila), KIAA1298, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, SSH1, hSSH-1L

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:27.30

小脳:63

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:237.30

目:158.70

動脈:-

静脈:66.60

リンパ節:10.10

末梢血:36.40

脾臓:-

胸腺:25.80

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:64

皮膚:43.20

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:1.90

小脳:-

脳幹:2.00

脳梁:1.96

松果体:1.89

末梢神経:-

脊柱:2.26

網膜:-

目:-

動脈:2.70

静脈:1.80

リンパ節:2.03

末梢血:-

脾臓:1.79

胸腺:0.96

骨髄:-

脂肪:1.86

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.25

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:82

胎盤:47.40

前立腺:90.10

卵巣:-

精巣:43.30

心臓:38.30

骨格筋:-

食道:-

胃:127.50

腸:-

結腸:84.80

肝臓:95

肺:58.70

膀胱:251.20

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:62.20

乳腺:55.80

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:1.88

胎盤:1.53

前立腺:1.96

卵巣:1.98

精巣:1.69

心臓:2.51

骨格筋:2.00

食道:1.73

胃:-

腸:1.69

結腸:1.99

肝臓:1.74

肺:2.43

膀胱:1.99

腎臓:1.53

下垂体:1.70

甲状腺:1.49

副腎:-

膵臓:1.98

乳腺:2.47

唾液腺:1.00

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.00

精巣:0.00

心臓:0.14

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.09

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:0.12

膵臓:-

乳腺:0.09

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001161331
Gene ID	54434
Unigene ID	Hs.199763
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000084112
GTEx ID	ENSG00000084112

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_198109
ラット[1]	NM_198109

染色体

12q24.11 [109,176,466 - 109,251,366]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000340	Dual specificity phosphatase, catalytic domain
IPR020422	Dual specificity phosphatase, subgroup, catalytic domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030036	actin cytoskeleton organization
GO:0000902	cell morphogenesis
GO:0071318	cellular response to ATP
GO:0006470	protein amino acid dephosphorylation
GO:0008064	regulation of actin polymerization or depolymerization
GO:0050770	regulation of axonogenesis
GO:0032268	regulation of cellular protein metabolic process
GO:0010591	regulation of lamellipodium assembly

Cellular Component

GO:0032154	cleavage furrow
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005856	cytoskeleton
GO:0030027	lamellipodium
GO:0030496	midbody
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0003779	actin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0004721	phosphoprotein phosphatase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0004725	protein tyrosine phosphatase activity
GO:0008138	protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity