exosome component 4

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同義遺伝子名

exosome component 4, Rrp41p, p12A, FLJ20591, hRrp41p, Ribosomal RNA-processing protein 41, EXOSC4, Ski6p, Exosome component 4, RRP41A, SKI6, Exosome complex exonuclease RRP41, RRP41

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:14.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:- 目:47 動脈:30 静脈:- リンパ節:- 末梢血:18.20 脾臓:18.90 胸腺:- 骨髄:39.40 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:-
GeneChip 大脳:6.03 小脳:6.22 脳幹:6.10 脳梁:5.80 松果体:- 末梢神経:6.05 脊柱:5.87 網膜:- 目:- 動脈:6.10 静脈:5.96 リンパ節:5.90 末梢血:- 脾臓:5.69 胸腺:5.89 骨髄:5.95 脂肪:6.02 骨:- 皮膚:6.54
CAGE 大脳:2.68 小脳:- 脳幹:2.58 脳梁:2.54 松果体:2.27 末梢神経:- 脊柱:2.31 網膜:- 目:- 動脈:2.26 静脈:2.25 リンパ節:2.46 末梢血:- 脾臓:2.71 胸腺:2.66 骨髄:- 脂肪:2.12 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.74 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.83 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.17 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:37.30 精巣:38.90 心臓:- 骨格筋:80.40 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:25.40     肝臓:10.60        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.16 胎盤:6.16 前立腺:6.50 卵巣:6.32 精巣:8.66 心臓:5.92 骨格筋:5.78 食道:6.44 胃:6.01 腸:6.10 結腸:6.16 肝臓:5.92 肺:5.90 膀胱:- 腎臓:6.31 下垂体:6.18 甲状腺:6.12 副腎:6.33 膵臓:6.24 乳腺:6.41 唾液腺:6.67
CAGE 子宮:2.16 胎盤:2.54 前立腺:2.45 卵巣:2.49 精巣:3.49 心臓:2.42 骨格筋:2.49 食道:2.52 胃:- 腸:2.19 結腸:2.60     肝臓:2.98    肺:2.19 膀胱:2.35 腎臓:2.78 下垂体:2.27 甲状腺:2.48 副腎:- 膵臓:2.71 乳腺:1.92 唾液腺:2.80
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.20 卵巣:3.51 精巣:4.85 心臓:2.18 骨格筋:2.57 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.06     肝臓:3.50        肺:2.49    膀胱:- 腎臓:3.70 下垂体:- 甲状腺:3.33 副腎:3.63 膵臓:- 乳腺:3.39 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_019037
Gene ID 54512
Unigene ID Hs.632041
Probe set ID 218695_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000178896
GTEx ID ENSG00000178896

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_175399
ラット [0]  

染色体

8q24.3  [145,133,529  -  145,135,550]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10465791
11110791
11719186
11790298
11812149
11879549
12419256
12477932
12788944
14527413
14702039
15231747
15489334
15635413
16341674
16912217
17174896
17545563
18172165
20531386
20531389
21139048
21182203
21255825
22863883
22939629
23000965
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051607  defense response to virus
GO:0045006  DNA deamination
GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0071044  histone mRNA catabolic process
GO:0000460  maturation of 5.8S rRNA
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0071028  nuclear mRNA surveillance
GO:0000956  nuclear-transcribed mRNA catabolic process
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0030307  positive regulation of cell growth
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0006364  rRNA processing

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0000178  exosome (RNase complex)
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0000175  3'-5'-exoribonuclease activity
GO:0017091  AU-rich element binding
GO:0004532  exoribonuclease activity
GO:0005515  protein binding