POU class 5 homeobox 1

同義遺伝子名

Octamer-binding transcription factor 3, Oct-3, MGC22487, Oct4, OTF4, OTF3, POU domain, class 5, transcription factor 1, POU5F1, OCT3, OCT4, Oct-4

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:16.60

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:121

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:6.71

小脳:7.07

脳幹:6.67

脳梁:6.82

松果体:-

末梢神経:6.67

脊柱:6.57

網膜:-

目:-

動脈:6.80

静脈:6.92

リンパ節:6.73

末梢血:-

脾臓:6.58

胸腺:6.74

骨髄:6.82

脂肪:6.84

骨:-

皮膚:6.71

CAGE

大脳:0

小脳:-

脳幹:0

脳梁:0

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.14

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.19

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.14

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:18.20

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:106.20

腸:-

結腸:8.50

肝臓:-

肺:4.90

膀胱:125.60

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.90

胎盤:6.59

前立腺:6.51

卵巣:6.94

精巣:6.41

心臓:6.84

骨格筋:7.02

食道:6.79

胃:6.93

腸:6.93

結腸:6.72

肝臓:6.80

肺:6.81

膀胱:-

腎臓:6.96

下垂体:6.81

甲状腺:6.83

副腎:6.67

膵臓:7.07

乳腺:6.67

唾液腺:6.80

CAGE

子宮:0

胎盤:0

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0

心臓:0

骨格筋:0

食道:0

胃:-

腸:0

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:0

腎臓:0

下垂体:0

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.79

卵巣:0.46

精巣:0.12

心臓:0.16

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.47

肝臓:0.05

肺:0.52

膀胱:-

腎臓:2.63

下垂体:-

甲状腺:0.02

副腎:0.22

膵臓:-

乳腺:0.17

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_203289
Gene ID	5460
Unigene ID	Hs.249184
Probe set ID	214532_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000204531
GTEx ID	ENSG00000204531

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_013633
ラット[1]	NM_013633

染色体

6p21.33 [31,132,114 - 31,148,508]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_QBL [31,119,639 - 31,130,942]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_MANN [31,172,166 - 31,183,436]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_SSTO [31,121,263 - 31,132,565]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_MCF [31,205,745 - 31,217,015]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_DBB [31,120,916 - 31,132,215]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_COX [31,119,738 - 31,131,037]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0009653	anatomical structure morphogenesis
GO:0001824	blastocyst development
GO:0003130	BMP signaling pathway involved in heart induction
GO:0060913	cardiac cell fate determination
GO:0060795	cell fate commitment involved in the formation of primary germ layers
GO:0001714	endodermal cell fate specification
GO:0042789	mRNA transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0060965	negative regulation of gene silencing by miRNA
GO:0060391	positive regulation of SMAD protein nuclear translocation
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0009786	regulation of asymmetric cell division
GO:0090081	regulation of canonical Wnt receptor signaling pathway involved in heart induction
GO:0010468	regulation of gene expression
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0009611	response to wounding
GO:0035019	somatic stem cell maintenance
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0035198	miRNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008134	transcription factor binding
GO:0031625	ubiquitin protein ligase binding

POU class 5 homeobox 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function