prolyl 4-hydroxylase, transmembrane (endoplasmic reticulum)

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同義遺伝子名

hypoxia-inducible factor prolyl 4-hydroxylase, PH-4

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:8.14 小脳:7.98 脳幹:8.05 脳梁:7.52 松果体:- 末梢神経:7.67 脊柱:7.54 網膜:- 目:- 動脈:7.13 静脈:6.78 リンパ節:7.10 末梢血:- 脾臓:6.86 胸腺:6.59 骨髄:6.38 脂肪:6.76 骨:- 皮膚:6.80
CAGE 大脳:4.08 小脳:- 脳幹:3.88 脳梁:3.91 松果体:4.34 末梢神経:- 脊柱:3.61 網膜:- 目:- 動脈:3.26 静脈:3.09 リンパ節:3.01 末梢血:- 脾臓:2.49 胸腺:2.38 骨髄:- 脂肪:2.59 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.68 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.49 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.98 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.95 胎盤:7.58 前立腺:7.65 卵巣:7.47 精巣:7.55 心臓:6.87 骨格筋:6.21 食道:6.58 胃:7.14 腸:7.19 結腸:7 肝臓:6.39 肺:7.13 膀胱:- 腎臓:7.59 下垂体:9.13 甲状腺:7.62 副腎:7.63 膵臓:7.48 乳腺:7.17 唾液腺:7.15
CAGE 子宮:3.25 胎盤:3.23 前立腺:3.23 卵巣:3.18 精巣:3.48 心臓:2.94 骨格筋:2.65 食道:2.76 胃:- 腸:3.23 結腸:3.55     肝臓:2.46    肺:3.14 膀胱:2.60 腎臓:3.16 下垂体:4.32 甲状腺:3.72 副腎:- 膵臓:4.07 乳腺:2.47 唾液腺:3.44
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.92 卵巣:3.18 精巣:3.13 心臓:1.87 骨格筋:2.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.66     肝臓:1.58        肺:3.32    膀胱:- 腎臓:3.26 下垂体:- 甲状腺:3.58 副腎:2.45 膵臓:- 乳腺:2.31 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_177939
Gene ID 54681
Unigene ID -
Probe set ID 222125_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000178467
GTEx ID ENSG00000178467

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_028944
ラット[1]  NM_028944

染色体

3p21.31  [49,027,319  -  49,044,587]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005123  Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase
IPR006620  Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11257307
12163023
12477932
12485997
12788921
14702039
15456751
15489334
16154531
17726031
21906983
23241241
23284715
23314748
23864651

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Cellular Component

GO:0005789  endoplasmic reticulum membrane
GO:0016021  integral to membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding
GO:0005506  iron ion binding
GO:0031418  L-ascorbic acid binding
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen