protein phosphatase, EF-hand calcium binding domain 1

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同義遺伝子名

PPP7C, Serine/threonine-protein phosphatase 7, Protein phosphatase with EF calcium-binding domain, PPEF1, PPEF, PPEF-1, PP7

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:36.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:30 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.75 小脳:4.04 脳幹:4.42 脳梁:4.09 松果体:- 末梢神経:7.05 脊柱:5.57 網膜:- 目:- 動脈:4.21 静脈:4.25 リンパ節:4 末梢血:- 脾臓:3.83 胸腺:3.86 骨髄:4.33 脂肪:4.28 骨:- 皮膚:4.17
CAGE 大脳:0.83 小脳:- 脳幹:0.54 脳梁:0.70 松果体:0.91 末梢神経:- 脊柱:2.59 網膜:- 目:- 動脈:0 静脈:0 リンパ節:0.03 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.12 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.28 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.03 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:82.20 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.85 胎盤:4.70 前立腺:4.02 卵巣:3.89 精巣:6.81 心臓:4.26 骨格筋:4.46 食道:4.03 胃:4.02 腸:4.30 結腸:4.28 肝臓:3.93 肺:4 膀胱:- 腎臓:3.95 下垂体:4.29 甲状腺:3.94 副腎:4.09 膵臓:4.41 乳腺:4.14 唾液腺:4.07
CAGE 子宮:0 胎盤:0 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0.20 骨格筋:0 食道:0 胃:- 腸:0 結腸:0     肝臓:0    肺:0.35 膀胱:0.18 腎臓:0 下垂体:0.34 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.10 卵巣:0.06 精巣:0.00 心臓:0.15 骨格筋:0.07 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.24     肝臓:0        肺:0.13    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.12 膵臓:- 乳腺:0.10 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_152226
Gene ID 5475
Unigene ID Hs.211589
Probe set ID 206547_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000086717
GTEx ID ENSG00000086717

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_011147
ラット [0]  

染色体

Xp22.13  [18,694,029  -  18,846,039]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002048  Calcium-binding EF-hand
IPR018249  EF-HAND 2
IPR004843  Metallophosphoesterase
IPR006186  Serine/threonine-specific protein phosphatase/bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9215685
9326663
9430683
10617768
11713293
12051765
12477932
12665801
14759258
15489334
15772651
22292511

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0050906  detection of stimulus involved in sensory perception
GO:0007603  phototransduction, visible light
GO:0006470  protein amino acid dephosphorylation
GO:0022400  regulation of rhodopsin mediated signaling pathway
GO:0016056  rhodopsin mediated signaling pathway

Cellular Component

GO:0005829  cytosol

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding
GO:0005506  iron ion binding
GO:0030145  manganese ion binding
GO:0005515  protein binding
GO:0004722  protein serine/threonine phosphatase activity