aprataxin

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同義遺伝子名

aprataxin, MGC1072, AOA, EOAHA, FLJ20157, Aprataxin, AOA1, AXA1, EAOH, APTX, FHA-HIT

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:45

小脳:63

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:112.30

網膜:-

目:52.90

動脈:30

静脈:-

リンパ節:50.60

末梢血:91.10

脾臓:37.80

胸腺:51.50

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:38.40

皮膚:81.60

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.37

小脳:-

脳幹:3.45

脳梁:3.48

松果体:3.36

末梢神経:-

脊柱:3.52

網膜:-

目:-

動脈:3.03

静脈:2.93

リンパ節:2.81

末梢血:-

脾臓:2.74

胸腺:2.81

骨髄:-

脂肪:2.90

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

nodata

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:69.20

前立腺:22.50

卵巣:37.30

精巣:112.50

心臓:51.10

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:25.40

肝臓:84.40

肺:63.50

膀胱:125.60

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:35.60

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:3.06

胎盤:2.81

前立腺:3.20

卵巣:2.68

精巣:3.34

心臓:2.77

骨格筋:2.81

食道:2.96

胃:-

腸:2.85

結腸:2.69

肝臓:2.79

肺:3.18

膀胱:2.81

腎臓:3.03

下垂体:3.50

甲状腺:3.02

副腎:-

膵臓:3.54

乳腺:2.64

唾液腺:3.11

RNA-seq

nodata

IDs

Refseq ID	NM_175071
Gene ID	54840
Unigene ID	Hs.20158
Probe set ID	-
Ensembl ID	-
GTEx ID	-

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]
ラット [0]

染色体

9p21.1 [32,972,604 - 33,025,166]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008219	cell death
GO:0006266	DNA ligation
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0031647	regulation of protein stability
GO:0006974	response to DNA damage stimulus
GO:0042542	response to hydrogen peroxide
GO:0000012	single strand break repair

Cellular Component

GO:0000785	chromatin
GO:0005737	cytoplasm
GO:0000790	nuclear chromatin
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0033699	DNA 5'-adenosine monophosphate hydrolase activity
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0003725	double-stranded RNA binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0008967	phosphoglycolate phosphatase activity
GO:0051219	phosphoprotein binding
GO:0046403	polynucleotide 3'-phosphatase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0047485	protein N-terminus binding

aprataxin

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function