aprataxin

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同義遺伝子名

aprataxin, MGC1072, AOA, EOAHA, FLJ20157, Aprataxin, AOA1, AXA1, EAOH, APTX, FHA-HIT

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:45

小脳:63

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:112.30

網膜:-

目:52.90

動脈:30

静脈:-

リンパ節:50.60

末梢血:91.10

脾臓:37.80

胸腺:51.50

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:38.40

皮膚:81.60

GeneChip

大脳:6.61

小脳:6.57

脳幹:6.64

脳梁:6.71

松果体:-

末梢神経:6.93

脊柱:6.65

網膜:-

目:-

動脈:6.39

静脈:6.10

リンパ節:6.44

末梢血:-

脾臓:6.57

胸腺:6.71

骨髄:6.31

脂肪:6.32

骨:-

皮膚:6.28

CAGE

大脳:3.37

小脳:-

脳幹:3.45

脳梁:3.48

松果体:3.36

末梢神経:-

脊柱:3.52

網膜:-

目:-

動脈:3.03

静脈:2.93

リンパ節:2.81

末梢血:-

脾臓:2.74

胸腺:2.81

骨髄:-

脂肪:2.90

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.26

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.19

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:69.20

前立腺:22.50

卵巣:37.30

精巣:112.50

心臓:51.10

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:25.40

肝臓:84.40

肺:63.50

膀胱:125.60

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:35.60

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.67

胎盤:6.23

前立腺:6.91

卵巣:6.77

精巣:6.87

心臓:6.07

骨格筋:5.74

食道:6.65

胃:6.62

腸:6.31

結腸:6.57

肝臓:6.77

肺:6.53

膀胱:-

腎臓:6.82

下垂体:6.65

甲状腺:6.57

副腎:6.97

膵臓:6.27

乳腺:6.68

唾液腺:6.24

CAGE

子宮:3.06

胎盤:2.81

前立腺:3.20

卵巣:2.68

精巣:3.34

心臓:2.77

骨格筋:2.81

食道:2.96

胃:-

腸:2.85

結腸:2.69

肝臓:2.79

肺:3.18

膀胱:2.81

腎臓:3.03

下垂体:3.50

甲状腺:3.02

副腎:-

膵臓:3.54

乳腺:2.64

唾液腺:3.11

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.39

卵巣:0.52

精巣:0.60

心臓:0.21

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.59

肝臓:0.06

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:1.34

下垂体:-

甲状腺:0.30

副腎:0.00

膵臓:-

乳腺:0.35

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_175073
Gene ID	54840
Unigene ID	Hs.20158
Probe set ID	218527_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000137074
GTEx ID	ENSG00000137074

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001025444, NM_025545
ラット[1]	NM_148889, NM_025545

染色体

9p21.1 [32,972,604 - 33,025,166]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008219	cell death
GO:0006266	DNA ligation
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0031647	regulation of protein stability
GO:0006974	response to DNA damage stimulus
GO:0042542	response to hydrogen peroxide
GO:0000012	single strand break repair

Cellular Component

GO:0000785	chromatin
GO:0005737	cytoplasm
GO:0000790	nuclear chromatin
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0033699	DNA 5'-adenosine monophosphate hydrolase activity
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0003725	double-stranded RNA binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0008967	phosphoglycolate phosphatase activity
GO:0051219	phosphoprotein binding
GO:0046403	polynucleotide 3'-phosphatase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0047485	protein N-terminus binding

aprataxin

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function