PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

PRPF40A, Formin-binding protein 3, FLAF1, FBP11, NY-REN-6 antigen, Huntingtin yeast partner A, FLJ20585, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, HYPA, Huntingtin-interacting protein HYPA/FBP11, FNBP3, NY-REN-6, FBP-11, HSPC225, formin-binding protein 3, HIP10, formin binding protein 3, Fas ligand-associated factor 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:19

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:47

動脈:179.90

静脈:-

リンパ節:111.20

末梢血:54.70

脾臓:37.80

胸腺:-

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:25.60

皮膚:43.20

GeneChip

大脳:6.96

小脳:6.77

脳幹:6.99

脳梁:7.57

松果体:-

末梢神経:7.45

脊柱:7.29

網膜:-

目:-

動脈:7.70

静脈:7.67

リンパ節:8.40

末梢血:-

脾臓:8.35

胸腺:8.94

骨髄:8.02

脂肪:7.60

骨:-

皮膚:8.09

CAGE

大脳:3.91

小脳:-

脳幹:4.15

脳梁:3.57

松果体:3.95

末梢神経:-

脊柱:4.07

網膜:-

目:-

動脈:3.35

静脈:4.07

リンパ節:3.83

末梢血:-

脾臓:4.37

胸腺:4.65

骨髄:-

脂肪:4.11

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.24

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.33

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.49

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:18.20

前立腺:56.30

卵巣:-

精巣:60.60

心臓:63.90

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:32.40

結腸:42.40

肝臓:105.60

肺:83.10

膀胱:-

腎臓:114.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:97.80

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.35

胎盤:7.98

前立腺:8.49

卵巣:8.44

精巣:7.97

心臓:7.41

骨格筋:7.16

食道:7.96

胃:7.91

腸:7.65

結腸:7.19

肝臓:7.93

肺:8.04

膀胱:-

腎臓:7.41

下垂体:7.50

甲状腺:8

副腎:7.99

膵臓:6.79

乳腺:8.19

唾液腺:7.25

CAGE

子宮:4.06

胎盤:4.23

前立腺:4.17

卵巣:4.17

精巣:4.40

心臓:3.90

骨格筋:4.25

食道:4.24

胃:-

腸:4.23

結腸:3.76

肝臓:4.24

肺:4.20

膀胱:4.17

腎臓:4.20

下垂体:4.24

甲状腺:4.05

副腎:-

膵臓:3.16

乳腺:3.47

唾液腺:3.34

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.62

卵巣:3.93

精巣:4.09

心臓:2.78

骨格筋:3.46

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.49

肝臓:2.92

肺:3.37

膀胱:-

腎臓:3.64

下垂体:-

甲状腺:4.04

副腎:3.69

膵臓:-

乳腺:3.24

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_017892
Gene ID	55660
Unigene ID	Hs.643580
Probe set ID	218053_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000196504
GTEx ID	ENSG00000196504

オーソログ対応遺伝子

マウス[9]	NM_018785
ラット[1]	NM_001106480

染色体

2q23.3 [153,508,107 - 153,574,511]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001202

WW/Rsp5/WWP

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007049	cell cycle
GO:0051301	cell division
GO:0016477	cell migration
GO:0007010	cytoskeleton organization
GO:0006397	mRNA processing
GO:0008360	regulation of cell shape
GO:0032465	regulation of cytokinesis
GO:0008380	RNA splicing

Cellular Component

GO:0016363	nuclear matrix
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0070064	proline-rich region binding
GO:0005515	protein binding

PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function