chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1

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同義遺伝子名

beta4GalNAcT, ChGn, FLJ11264

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:6.43 小脳:4.32 脳幹:6.12 脳梁:6.36 松果体:- 末梢神経:7.20 脊柱:6.49 網膜:- 目:- 動脈:6.20 静脈:7.71 リンパ節:5.85 末梢血:- 脾臓:5.42 胸腺:5.26 骨髄:7.44 脂肪:6.42 骨:- 皮膚:5.58
CAGE 大脳:3.50 小脳:- 脳幹:2.74 脳梁:3.22 松果体:1.97 末梢神経:- 脊柱:3.39 網膜:- 目:- 動脈:3.18 静脈:3.10 リンパ節:2.83 末梢血:- 脾臓:2.77 胸腺:2.23 骨髄:- 脂肪:3.21 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.68 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.02 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.74 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:10.90 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.95 胎盤:8.43 前立腺:8.49 卵巣:7.08 精巣:4.40 心臓:7.36 骨格筋:4.82 食道:5.68 胃:5.87 腸:5.38 結腸:4.97 肝臓:3.93 肺:6.12 膀胱:- 腎臓:5.03 下垂体:5.24 甲状腺:9.07 副腎:6.52 膵臓:5.51 乳腺:5.55 唾液腺:5.35
CAGE 子宮:3.02 胎盤:3.63 前立腺:3.12 卵巣:3.47 精巣:1.88 心臓:3.10 骨格筋:1.45 食道:2.62 胃:- 腸:1.84 結腸:2.11     肝臓:0.55    肺:2.70 膀胱:2.99 腎臓:1.86 下垂体:2.55 甲状腺:3.81 副腎:- 膵臓:3.02 乳腺:2.83 唾液腺:1.75
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.09 卵巣:1.42 精巣:1.22 心臓:0.33 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.98     肝臓:0.12        肺:1.45    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:2.50 副腎:1.92 膵臓:- 乳腺:0.08 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001130518
Gene ID 55790
Unigene ID Hs.613729
Probe set ID 219049_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000147408
GTEx ID ENSG00000147408

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_172753
ラット[1]  NM_001107309

染色体

8p21.3  [19,261,672  -  19,615,540]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11514575
11788602
12163485
12446672
12477932
12975309
14702039
15489334
16344560
17145758
19701759
19730683
20379614
21160489
22156920
22939629
23726668
23748413

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009653  anatomical structure morphogenesis
GO:0005975  carbohydrate metabolic process
GO:0051216  cartilage development
GO:0008283  cell proliferation
GO:0008037  cell recognition
GO:0030206  chondroitin sulfate biosynthetic process
GO:0030204  chondroitin sulfate metabolic process
GO:0050650  chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process
GO:0050653  chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process, polysaccharide chain biosynthetic process
GO:0050651  dermatan sulfate proteoglycan biosynthetic process
GO:0001958  endochondral ossification
GO:0030198  extracellular matrix organization
GO:0030203  glycosaminoglycan metabolic process
GO:0015014  heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process, polysaccharide chain biosynthetic process
GO:0030210  heparin biosynthetic process
GO:0007399  nervous system development
GO:0030166  proteoglycan biosynthetic process
GO:0046398  UDP-glucuronate metabolic process
GO:0019276  UDP-N-acetylgalactosamine metabolic process

Cellular Component

GO:0032580  Golgi cisterna membrane
GO:0000139  Golgi membrane
GO:0030173  integral to Golgi membrane
GO:0005622  intracellular

Molecular Function

GO:0008376  acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0047238  glucuronosyl-N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 4-beta-N-acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0015020  glucuronosyltransferase activity
GO:0047237  glucuronylgalactosylproteoglycan 4-beta-N-acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0008955  peptidoglycan glycosyltransferase activity