protocadherin gamma subfamily C, 5

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同義遺伝子名

PCDH-gamma-C5, PCDH-GAMMA-C5, MGC138288, MGC138286, protocadherin gamma subfamily C, 5, PCDHGC5, Protocadherin gamma C5 precursor

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:9.92 小脳:9.80 脳幹:9.42 脳梁:10.20 松果体:- 末梢神経:9.28 脊柱:10.51 網膜:- 目:- 動脈:9.14 静脈:8.88 リンパ節:8.28 末梢血:- 脾臓:8.14 胸腺:7.38 骨髄:7.78 脂肪:9.12 骨:- 皮膚:8.54
CAGE 大脳:3.33 小脳:- 脳幹:1.69 脳梁:2.51 松果体:0.36 末梢神経:- 脊柱:1.31 網膜:- 目:- 動脈:0.69 静脈:0 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.82 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.14 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:9.03 胎盤:8.05 前立腺:8.35 卵巣:8.76 精巣:8.34 心臓:8.74 骨格筋:7.31 食道:8.53 胃:8.62 腸:8.28 結腸:8.42 肝臓:8.12 肺:9.25 膀胱:- 腎臓:8.27 下垂体:9.59 甲状腺:8.66 副腎:9.16 膵臓:7.54 乳腺:9.17 唾液腺:8.38
CAGE 子宮:0.20 胎盤:0 前立腺:0.08 卵巣:0.07 精巣:0.53 心臓:0.07 骨格筋:0 食道:0.18 胃:- 腸:0.07 結腸:0.08     肝臓:0    肺:0.14 膀胱:0.09 腎臓:0 下垂体:0.19 甲状腺:0.06 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.36 卵巣:0.21 精巣:0.15 心臓:0.25 骨格筋:0.12 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.17     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0.05 下垂体:- 甲状腺:0.08 副腎:0.16 膵臓:- 乳腺:0.10 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018929
Gene ID 56097
Unigene ID -
Probe set ID 209079_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000240764
GTEx ID ENSG00000240764

オーソログ対応遺伝子

マウス[9]  NM_033578, NM_033581, NM_033582, NM_033583, NM_033586, NM_033591, NM_033592, NM_033594, NM_033595
ラット[9]  NM_033578, NM_033581, NM_033582, NM_033583, NM_033586, NM_033591, NM_033592, NM_033594, NM_033595

染色体

5q31.3  [140,868,808  -  140,892,546]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10380929
10716726
10817752
10835267
11230163
12477932
18029348
21832049

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007156  homophilic cell adhesion

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding