protocadherin gamma subfamily A, 1

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同義遺伝子名

protocadherin gamma subfamily A, 1, PCDHGA1, Protocadherin gamma A1 precursor, PCDH-GAMMA-A1, MGC138287, PCDH-gamma-A1, MGC138289

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:4.40 小脳:4.59 脳幹:4.34 脳梁:4.29 松果体:- 末梢神経:4.26 脊柱:4.33 網膜:- 目:- 動脈:4.26 静脈:4.18 リンパ節:4.12 末梢血:- 脾臓:3.85 胸腺:4 骨髄:4.17 脂肪:4.31 骨:- 皮膚:4.36
CAGE 大脳:1.03 小脳:- 脳幹:1.07 脳梁:0.96 松果体:0.64 末梢神経:- 脊柱:1.00 網膜:- 目:- 動脈:0.47 静脈:0.47 リンパ節:0.03 末梢血:- 脾臓:0.51 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0.26 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.55 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.07 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:4.16 胎盤:3.97 前立腺:4.03 卵巣:4.15 精巣:4.18 心臓:4.79 骨格筋:4.21 食道:4.22 胃:4.01 腸:4.10 結腸:4.34 肝臓:4.03 肺:4.16 膀胱:- 腎臓:4.18 下垂体:4.51 甲状腺:4.04 副腎:4.36 膵臓:4.10 乳腺:4.08 唾液腺:4.25
CAGE 子宮:0.64 胎盤:0.30 前立腺:0.21 卵巣:0.95 精巣:0.89 心臓:0.56 骨格筋:0.30 食道:0.09 胃:- 腸:0 結腸:0.15     肝臓:0    肺:0.27 膀胱:0.46 腎臓:0.15 下垂体:0.98 甲状腺:0.12 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.28 卵巣:0.34 精巣:0.23 心臓:0.00 骨格筋:0.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.14     肝臓:0.00        肺:0.14    膀胱:- 腎臓:0.12 下垂体:- 甲状腺:0.19 副腎:0.07 膵臓:- 乳腺:0.14 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018912
Gene ID 56114
Unigene ID -
Probe set ID 211880_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000204956
GTEx ID ENSG00000204956

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット [0]  

染色体

5q31.3  [140,710,252  -  140,892,546]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10380929
10716726
10817752
10835267
11230163
12477932
20379614

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007156  homophilic cell adhesion

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding