protocadherin beta 13

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同義遺伝子名

PCDHB13, PCDH-BETA13, protocadherin beta 13, Protocadherin beta 13 precursor, PCDH-beta13, UNQ332/PRO531

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:4.70 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:19.20
GeneChip 大脳:5.12 小脳:5.49 脳幹:4.94 脳梁:5.15 松果体:- 末梢神経:5.17 脊柱:5.14 網膜:- 目:- 動脈:5.40 静脈:5.61 リンパ節:5.07 末梢血:- 脾臓:4.96 胸腺:4.81 骨髄:5.22 脂肪:5.33 骨:- 皮膚:5.36
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:0.69 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.82 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.96 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.62 胎盤:5.09 前立腺:5.19 卵巣:5.41 精巣:5.59 心臓:5.32 骨格筋:5.02 食道:5.08 胃:5.09 腸:5.29 結腸:5.03 肝臓:5.15 肺:5.23 膀胱:- 腎臓:5.04 下垂体:5.35 甲状腺:5.11 副腎:4.96 膵臓:5.74 乳腺:5.20 唾液腺:5.37
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.23 卵巣:1.13 精巣:0.89 心臓:0.99 骨格筋:0.28 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.97     肝臓:0.16        肺:1.01    膀胱:- 腎臓:0.67 下垂体:- 甲状腺:0.88 副腎:0.85 膵臓:- 乳腺:0.82 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018933
Gene ID 56123
Unigene ID Hs.283803
Probe set ID 221450_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000187372
GTEx ID ENSG00000187372

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_053141
ラット[1]  NM_053141

染色体

5q31.3  [140,593,509  -  140,596,993]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10380929
10716726
10817752
10835267
11230163
11322959
12231349
12477932
12975309
14702039
15489334

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016339  calcium-dependent cell-cell adhesion
GO:0007156  homophilic cell adhesion
GO:0007416  synapse assembly
GO:0007268  synaptic transmission

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding