peptidoglycan recognition protein 4

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同義遺伝子名

peptidoglycan recognition protein 4, PGRP-Ibeta, PGRPIB, PGLYRPIbeta, Peptidoglycan recognition protein I-beta precursor, PGLYRP4, Peptidoglycan recognition protein 4, PGRP-I-beta, SBBI67

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:5.59 小脳:5.47 脳幹:5.56 脳梁:5.58 松果体:- 末梢神経:5.61 脊柱:5.76 網膜:- 目:- 動脈:5.57 静脈:5.53 リンパ節:5.51 末梢血:- 脾臓:5.26 胸腺:5.16 骨髄:5.69 脂肪:5.75 骨:- 皮膚:6.02
CAGE 大脳:0 小脳:- 脳幹:0 脳梁:0 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:0 網膜:- 目:- 動脈:0 静脈:0 リンパ節:0.62 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.18 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:38.30 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.12 胎盤:5.18 前立腺:5.03 卵巣:4.91 精巣:5.31 心臓:5.88 骨格筋:5.64 食道:5.66 胃:5.37 腸:5.38 結腸:5.72 肝臓:5.71 肺:5.17 膀胱:- 腎臓:5.65 下垂体:5.81 甲状腺:5.40 副腎:5.70 膵臓:5.82 乳腺:5.36 唾液腺:5.67
CAGE 子宮:0.81 胎盤:0.30 前立腺:0.08 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:1.31 胃:- 腸:0.14 結腸:0     肝臓:0    肺:0.14 膀胱:0 腎臓:0 下垂体:0 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0.36
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0.12    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0.06 膵臓:- 乳腺:0 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_020393
Gene ID 57115
Unigene ID Hs.58356
Probe set ID 220944_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000163218
GTEx ID ENSG00000163218

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_001165968, NM_207263
ラット [0]  

染色体

1q21.3  [153,302,596  -  153,321,316]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002502  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 2
IPR015510  Peptidoglycan recognition protein
IPR006619  Peptidoglycan recognition protein, metazoa/bacteria

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11461926
12477932
15489334
16354652
16362825
17502600
20237496
20379614
23867815

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0050830  defense response to Gram-positive bacterium
GO:0016045  detection of bacterium
GO:0044117  growth of symbiont in host
GO:0045087  innate immune response
GO:0032689  negative regulation of interferon-gamma production
GO:0032827  negative regulation of natural killer cell differentiation during immune response
GO:0009253  peptidoglycan catabolic process

Cellular Component

GO:0005576  extracellular region
GO:0005622  intracellular
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0008745  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity
GO:0042834  peptidoglycan binding
GO:0016019  peptidoglycan receptor activity
GO:0008270  zinc ion binding