SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1

同義遺伝子名

SMURF-1, Smurf 1, Ubiquitin--protein ligase SMURF1, SMURF 1, Smurf-1, Smad-specific E3 ubiquitin ligase 1, KIAA1625, hSMURF1, SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, SMURF1, Smad ubiquitination regulatory factor 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:34.40

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:122.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:52.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:18.20

脾臓:18.90

胸腺:25.80

骨髄:137.80

脂肪:40.30

骨:-

皮膚:105.60

GeneChip

大脳:5.95

小脳:5.71

脳幹:5.85

脳梁:6.19

松果体:-

末梢神経:6.13

脊柱:6.18

網膜:-

目:-

動脈:6.41

静脈:6.06

リンパ節:5.74

末梢血:-

脾臓:5.65

胸腺:5.53

骨髄:5.08

脂肪:6.15

骨:-

皮膚:6.53

CAGE

大脳:2.86

小脳:-

脳幹:3.30

脳梁:3.59

松果体:2.68

末梢神経:-

脊柱:2.90

網膜:-

目:-

動脈:3.25

静脈:2.71

リンパ節:2.64

末梢血:-

脾臓:2.63

胸腺:2.33

骨髄:-

脂肪:3.05

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.67

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.43

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:58.30

前立腺:101.40

卵巣:111.80

精巣:121.10

心臓:25.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:106.20

腸:-

結腸:178.10

肝臓:42.20

肺:44

膀胱:-

腎臓:114.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:71.10

乳腺:92.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.89

胎盤:6.85

前立腺:6.28

卵巣:6.16

精巣:7.46

心臓:5.37

骨格筋:5.72

食道:6.58

胃:6.05

腸:5.75

結腸:5.85

肝臓:5.80

肺:6.09

膀胱:-

腎臓:5.59

下垂体:5.69

甲状腺:5.42

副腎:6.16

膵臓:5.35

乳腺:6.27

唾液腺:5.53

CAGE

子宮:3.02

胎盤:3.18

前立腺:2.89

卵巣:2.86

精巣:3.91

心臓:2.55

骨格筋:2.51

食道:3.09

胃:-

腸:2.92

結腸:2.83

肝臓:2.52

肺:3.05

膀胱:2.90

腎臓:2.70

下垂体:2.74

甲状腺:2.34

副腎:-

膵臓:3.47

乳腺:2.64

唾液腺:2.46

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.23

卵巣:0.16

精巣:1.09

心臓:0.15

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.05

副腎:0.00

膵臓:-

乳腺:0.37

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_020429
Gene ID	57154
Unigene ID	Hs.189329
Probe set ID	212666_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000198742
GTEx ID	ENSG00000198742

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001038627, NM_029438
ラット [0]

染色体

7q22.1 [98,625,061 - 98,741,723]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000008	C2 calcium-dependent membrane targeting
IPR008973	C2 calcium/lipid-binding domain, CaLB
IPR018029	C2 membrane targeting protein
IPR001202	WW/Rsp5/WWP

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030509	BMP signaling pathway
GO:0030154	cell differentiation
GO:0007398	ectoderm development
GO:0030514	negative regulation of BMP signaling pathway
GO:0030279	negative regulation of ossification
GO:0030512	negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
GO:0031398	positive regulation of protein ubiquitination
GO:0043161	proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0006611	protein export from nucleus
GO:0034394	protein localization at cell surface
GO:0000209	protein polyubiquitination
GO:0016567	protein ubiquitination
GO:0042787	protein ubiquitination during ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0032801	receptor catabolic process
GO:0007179	transforming growth factor beta receptor signaling pathway
GO:0030579	ubiquitin-dependent SMAD protein catabolic process

Cellular Component

GO:0043025	cell soma
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0048185	activin binding
GO:0070411	I-SMAD binding
GO:0005515	protein binding
GO:0070412	R-SMAD binding
GO:0004842	ubiquitin-protein ligase activity

SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function