patched homolog 1 (Drosophila)

同義遺伝子名

PTCH1, PTC1, NBCCS, patched homolog (Drosophila), Protein patched homolog 1, patched (Drosophila) homolog, FLJ42602, patched homolog 1 (Drosophila), BCNS, HPE7, PTCH

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:21.30

小脳:151.10

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:-

目:64.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:18.90

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:24

GeneChip

大脳:6.38

小脳:8.31

脳幹:6.62

脳梁:6.27

松果体:-

末梢神経:9.20

脊柱:6.21

網膜:-

目:-

動脈:5.95

静脈:4.75

リンパ節:5.38

末梢血:-

脾臓:5.79

胸腺:4.36

骨髄:3.81

脂肪:5.27

骨:-

皮膚:5.60

CAGE

大脳:1.95

小脳:-

脳幹:2.14

脳梁:2.26

松果体:1.65

末梢神経:-

脊柱:2.12

網膜:-

目:-

動脈:2.02

静脈:1.23

リンパ節:1.61

末梢血:-

脾臓:1.67

胸腺:0.80

骨髄:-

脂肪:1.12

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:14.60

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:86.50

心臓:25.50

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:33.90

肝臓:-

肺:19.60

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:35.60

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.30

胎盤:5.34

前立腺:7.60

卵巣:6.73

精巣:7.39

心臓:5.07

骨格筋:4.66

食道:4.56

胃:7.52

腸:6.69

結腸:7.46

肝臓:4.85

肺:6.45

膀胱:-

腎臓:5.93

下垂体:6.76

甲状腺:6.85

副腎:6.91

膵臓:4.89

乳腺:5.54

唾液腺:6.25

CAGE

子宮:2.57

胎盤:1.11

前立腺:1.88

卵巣:1.29

精巣:2.70

心臓:1.40

骨格筋:0.95

食道:1.48

胃:-

腸:2.23

結腸:2.92

肝臓:0.78

肺:2.13

膀胱:1.45

腎臓:1.48

下垂体:1.42

甲状腺:1.96

副腎:-

膵臓:2.54

乳腺:2.27

唾液腺:2.43

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.00

精巣:0.00

心臓:0.00

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.42

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.39

副腎:0.00

膵臓:-

乳腺:0.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001083604
Gene ID	5727
Unigene ID	Hs.494538
Probe set ID	209815_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000185920
GTEx ID	ENSG00000185920

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008957
ラット [0]

染色体

9q22.32 [98,205,262 - 98,279,339]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003392	Patched
IPR004766	Transmembrane receptor, patched

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007420	brain development
GO:0001658	branching involved in ureteric bud morphogenesis
GO:0071397	cellular response to cholesterol
GO:0009953	dorsal/ventral pattern formation
GO:0030326	embryonic limb morphogenesis
GO:0008544	epidermis development
GO:0042593	glucose homeostasis
GO:0003007	heart morphogenesis
GO:0035137	hindlimb morphogenesis
GO:0043616	keratinocyte proliferation
GO:0035108	limb morphogenesis
GO:0060603	mammary gland duct morphogenesis
GO:0060644	mammary gland epithelial cell differentiation
GO:0051782	negative regulation of cell division
GO:0050680	negative regulation of epithelial cell proliferation
GO:0040015	negative regulation of multicellular organism growth
GO:0045668	negative regulation of osteoblast differentiation
GO:0045879	negative regulation of smoothened signaling pathway
GO:0043433	negative regulation of transcription factor activity
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0021997	neural plate axis specification
GO:0001843	neural tube closure
GO:0021532	neural tube patterning
GO:0009887	organ morphogenesis
GO:0060037	pharyngeal system development
GO:0010875	positive regulation of cholesterol efflux
GO:0016485	protein processing
GO:0007346	regulation of mitotic cell cycle
GO:0032880	regulation of protein localization
GO:0008589	regulation of smoothened signaling pathway
GO:0010157	response to chlorate
GO:0007224	smoothened signaling pathway
GO:0060831	smoothened signaling pathway involved in dorsal/ventral neural tube patterning
GO:0021522	spinal cord motor neuron differentiation

Cellular Component

GO:0005901	caveola
GO:0005794	Golgi apparatus
GO:0016021	integral to membrane
GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0030496	midbody
GO:0048471	perinuclear region of cytoplasm
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0015485	cholesterol binding
GO:0030332	cyclin binding
GO:0008158	hedgehog receptor activity
GO:0008201	heparin binding
GO:0005113	patched binding
GO:0005515	protein binding
GO:0032403	protein complex binding
GO:0005119	smoothened binding

patched homolog 1 (Drosophila)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function