CCR4-NOT transcription complex, subunit 6

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同義遺伝子名

Cytoplasmic deadenylase, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, Carbon catabolite repressor protein 4 homolog, CCR4 carbon catabolite repression 4-like, KIAA1194, CNOT6, CCR4-NOT transcription complex, subunit 6

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.02 小脳:6.75 脳幹:6.03 脳梁:6.44 松果体:- 末梢神経:6.23 脊柱:6.25 網膜:- 目:- 動脈:5.96 静脈:5.79 リンパ節:6.33 末梢血:- 脾臓:6.41 胸腺:7.57 骨髄:7.06 脂肪:6 骨:- 皮膚:6.24
CAGE 大脳:3.27 小脳:- 脳幹:2.94 脳梁:3.19 松果体:3.70 末梢神経:- 脊柱:2.91 網膜:- 目:- 動脈:2.92 静脈:3.06 リンパ節:3.09 末梢血:- 脾臓:3.48 胸腺:3.69 骨髄:- 脂肪:3.04 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.31 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.06 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.02 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.70 胎盤:6.91 前立腺:7.06 卵巣:6.81 精巣:6.83 心臓:5.91 骨格筋:5.82 食道:6.54 胃:6.32 腸:6.38 結腸:6.28 肝臓:5.63 肺:6.20 膀胱:- 腎臓:6.40 下垂体:6.03 甲状腺:6.57 副腎:5.92 膵臓:5.56 乳腺:6.36 唾液腺:5.91
CAGE 子宮:3.27 胎盤:3.45 前立腺:3.34 卵巣:3.03 精巣:3.43 心臓:3.21 骨格筋:2.54 食道:3.39 胃:- 腸:3.67 結腸:3.29     肝臓:2.22    肺:3.08 膀胱:3.21 腎臓:3.24 下垂体:3.07 甲状腺:3.11 副腎:- 膵臓:2.66 乳腺:2.95 唾液腺:2.57
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.12 卵巣:3.47 精巣:3.69 心臓:2.27 骨格筋:1.42 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.12     肝臓:1.47        肺:2.93    膀胱:- 腎臓:2.94 下垂体:- 甲状腺:3.04 副腎:2.95 膵臓:- 乳腺:2.95 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_015455
Gene ID 57472
Unigene ID -
Probe set ID 217970_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000113300
GTEx ID ENSG00000113300

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_212484
ラット[1]  NM_001013856

染色体

5q35.3  [179,921,412  -  180,005,405]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8586417
10574462
10637334
11747467
11889047
12477932
12771185
14702039
15314026
16341674
17452450
17785442
18180299
18818012
19322201
19558367
19716330
19875381
19946888
20360068
21139048
21233283
21906983
22505724

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0035195  gene silencing by miRNA
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0070966  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay
GO:0000289  nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0008284  positive regulation of cell proliferation
GO:0010606  positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006417  regulation of translation
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0030014  CCR4-NOT complex
GO:0005829  cytosol
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0004532  exoribonuclease activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0004535  poly(A)-specific ribonuclease activity
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding