sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A

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同義遺伝子名

Semaphorin-6A precursor, VIA, Semaphorin 6A-1, SEMAQ, SEMA, SEMA6A-1, SEMA6A1, Sema VIA, KIAA1368, Semaphorin VIA, HT018, sema VIa, SEMA6A

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:123.30 小脳:88.20 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:112.30 網膜:118.60 目:111.70 動脈:- 静脈:- リンパ節:60.70 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:124.80
GeneChip 大脳:6.68 小脳:6 脳幹:6.86 脳梁:7.25 松果体:- 末梢神経:5.96 脊柱:7 網膜:- 目:- 動脈:5.72 静脈:5.92 リンパ節:5.84 末梢血:- 脾臓:5.67 胸腺:4.59 骨髄:5.48 脂肪:5.91 骨:- 皮膚:5.58
CAGE 大脳:4.64 小脳:- 脳幹:5.07 脳梁:5.24 松果体:5.73 末梢神経:- 脊柱:5.43 網膜:- 目:- 動脈:3.12 静脈:3.49 リンパ節:2.94 末梢血:- 脾臓:3.59 胸腺:2.04 骨髄:- 脂肪:3.74 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.74 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.71 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.38 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:91.10 胎盤:222.20 前立腺:22.50 卵巣:149.10 精巣:34.60 心臓:89.40 骨格筋:40.20 食道:- 胃:- 腸:64.80 結腸:25.40     肝臓:10.60        肺:78.20    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:152.40 膵臓:62.20 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.60 胎盤:7.17 前立腺:5.41 卵巣:5.54 精巣:5.49 心臓:6.12 骨格筋:5.95 食道:5.57 胃:6.01 腸:6.06 結腸:6.42 肝臓:6.17 肺:6.37 膀胱:- 腎臓:5.86 下垂体:5.62 甲状腺:5.45 副腎:7.37 膵臓:6.17 乳腺:5.62 唾液腺:6.65
CAGE 子宮:3.46 胎盤:4.97 前立腺:3.07 卵巣:3.39 精巣:3.25 心臓:3.20 骨格筋:2.81 食道:2.88 胃:- 腸:4.64 結腸:4.49     肝臓:3.06    肺:4.42 膀胱:3.07 腎臓:3.09 下垂体:2.47 甲状腺:2.94 副腎:- 膵臓:3.45 乳腺:4.25 唾液腺:4.11
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.98 卵巣:2.10 精巣:2.10 心臓:1.23 骨格筋:0.82 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.55     肝臓:1.74        肺:3.18    膀胱:- 腎臓:1.66 下垂体:- 甲状腺:1.69 副腎:3.54 膵臓:- 乳腺:2.76 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_020796
Gene ID 57556
Unigene ID Hs.156967
Probe set ID 220454_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000092421
GTEx ID ENSG00000092421

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_018744
ラット[2]  NM_018744

染色体

5q23.1  [115,779,312  -  115,910,630]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659  Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9204478
10718198
10993894
11242070
12421765
12477932
14702039
15561718
16303743
16436660
17671748
18187809
19451621
19578876
20379614
22036096
22184411
23740775
24024966

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006915  apoptosis
GO:0007411  axon guidance
GO:0007166  cell surface receptor linked signal transduction
GO:0051642  centrosome localization
GO:0007010  cytoskeleton organization
GO:0007399  nervous system development
GO:0001764  neuron migration
GO:0009887  organ morphogenesis

Cellular Component

GO:0030424  axon
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005887  integral to plasma membrane

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0030215  semaphorin receptor binding
GO:0004888  transmembrane receptor activity