pogo transposable element with KRAB domain

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同義遺伝子名

POGK, KIAA15131, LST003, KIAA1513, pogo transposable element with KRAB domain, LST003/SLTP003, Pogo transposable element with KRAB domain, BASS2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:78.20 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:- 末梢神経:122.70 脊柱:112.30 網膜:- 目:17.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:101.10 末梢血:18.20 脾臓:18.90 胸腺:64.40 骨髄:78.70 脂肪:40.30 骨:51.20 皮膚:38.40
GeneChip 大脳:7.56 小脳:7.36 脳幹:7.53 脳梁:8.21 松果体:- 末梢神経:7.60 脊柱:7.76 網膜:- 目:- 動脈:6.75 静脈:6.51 リンパ節:6.76 末梢血:- 脾臓:7.02 胸腺:6.61 骨髄:6.47 脂肪:6.56 骨:- 皮膚:6.87
CAGE 大脳:3.79 小脳:- 脳幹:3.80 脳梁:4.10 松果体:3.64 末梢神経:- 脊柱:4.19 網膜:- 目:- 動脈:3.82 静脈:3.25 リンパ節:3.24 末梢血:- 脾臓:3.32 胸腺:2.89 骨髄:- 脂肪:2.95 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.79 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.14 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.94 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:82 胎盤:29.10 前立腺:- 卵巣:- 精巣:34.60 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:342.80 胃:- 腸:- 結腸:17     肝臓:10.60        肺:78.20    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:80 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.22 胎盤:7.41 前立腺:7.01 卵巣:7.16 精巣:6.28 心臓:6.62 骨格筋:6.17 食道:7.04 胃:6.91 腸:6.72 結腸:7.02 肝臓:6.21 肺:7.28 膀胱:- 腎臓:7.12 下垂体:6.52 甲状腺:6.66 副腎:6.23 膵臓:6.50 乳腺:7.14 唾液腺:6.37
CAGE 子宮:3.33 胎盤:3.36 前立腺:3.09 卵巣:3.28 精巣:2.70 心臓:3.48 骨格筋:2.63 食道:3.14 胃:- 腸:2.70 結腸:3.33     肝臓:2.74    肺:3.77 膀胱:3.10 腎臓:3.01 下垂体:3.09 甲状腺:3.09 副腎:- 膵臓:3.32 乳腺:4.00 唾液腺:3.08
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.88 卵巣:4.31 精巣:3.21 心臓:2.54 骨格筋:1.98 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.47     肝臓:2.61        肺:3.59    膀胱:- 腎臓:3.90 下垂体:- 甲状腺:3.29 副腎:3.38 膵臓:- 乳腺:2.77 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_017542
Gene ID 57645
Unigene ID Hs.432752
Probe set ID 218229_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000143157
GTEx ID ENSG00000143157

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001142948, NM_175170
ラット[1]  NM_001107194, NM_175170

染色体

1q24.1  [166,808,681  -  166,825,581]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001909  Krueppel-associated box
IPR003655  Krueppel-associated box-related
IPR006600  Pogo transposase / Cenp-B / PDC2, DNA-binding HTH domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8619474
9110174
10509013
10819331
12477932
14702039
16964243
18029348
19064610
19322201
19536175
20360068
21832049
21900206
21963094
22053931
22939624
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0005515  protein binding