chromodomain helicase DNA binding protein 8

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同義遺伝子名

helicase with SNF2 domain 1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, ATP-dependent helicase CHD8, chromodomain helicase DNA binding protein 8, CHD-8, DKFZp686N17164, HELSNF1, CHD8, DUPLIN, Helicase with SNF2 domain 1, KIAA1564

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:49.80 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:118.60 目:94 動脈:- 静脈:- リンパ節:91 末梢血:- 脾臓:132.30 胸腺:51.50 骨髄:59 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:52.80
GeneChip 大脳:7.16 小脳:7.39 脳幹:6.96 脳梁:7.11 松果体:- 末梢神経:7.13 脊柱:6.92 網膜:- 目:- 動脈:7.39 静脈:6.58 リンパ節:7.54 末梢血:- 脾臓:7.83 胸腺:7.56 骨髄:7.02 脂肪:6.91 骨:- 皮膚:7.39
CAGE 大脳:3.35 小脳:- 脳幹:3.38 脳梁:3.79 松果体:3.42 末梢神経:- 脊柱:3.13 網膜:- 目:- 動脈:3.38 静脈:2.97 リンパ節:3.44 末梢血:- 脾臓:3.32 胸腺:3.72 骨髄:- 脂肪:3.03 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.04 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.72 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.42 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:32.80 前立腺:112.60 卵巣:- 精巣:30.30 心臓:63.90 骨格筋:- 食道:- 胃:127.50 腸:- 結腸:42.40     肝臓:105.60        肺:73.30    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:232 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.37 胎盤:6.58 前立腺:7.42 卵巣:7.45 精巣:7.42 心臓:6.59 骨格筋:6.33 食道:7.36 胃:7.26 腸:6.55 結腸:6.84 肝臓:6.91 肺:7.08 膀胱:- 腎臓:7.04 下垂体:7.57 甲状腺:7.47 副腎:7.14 膵臓:5.76 乳腺:7.49 唾液腺:6.79
CAGE 子宮:3.42 胎盤:3.17 前立腺:3.37 卵巣:3.27 精巣:3.30 心臓:2.67 骨格筋:2.45 食道:3.11 胃:- 腸:3.05 結腸:3.04     肝臓:2.78    肺:2.95 膀胱:3.14 腎臓:3.12 下垂体:3.46 甲状腺:3.08 副腎:- 膵臓:3.29 乳腺:2.79 唾液腺:3.15
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.79 卵巣:3.33 精巣:3.42 心臓:1.33 骨格筋:1.49 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.38     肝臓:1.68        肺:2.06    膀胱:- 腎臓:2.45 下垂体:- 甲状腺:3.23 副腎:3.37 膵臓:- 乳腺:2.44 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_020920
Gene ID 57680
Unigene ID Hs.530698
Probe set ID 212571_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000100888
GTEx ID ENSG00000100888

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_201637
ラット[1]  NM_022933

染色体

14q11.2  [21,853,353  -  21,924,285]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953  Chromo domain
IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7505766
10921920
10997877
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11744694
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15146197
15367660
15456888
15489334
15960975
16344560
16949368
16964243
17000644
17081983
17846119
17938208
18378692
18729074
19151705
19255092
19454010
19471022
20085832
20215423
20308527
20453063
20811636
20936779
21139048
21653943
21693764
21906983
21988832
22083958
22412018
22495309
22495311
22505724
22586326
23667531
23835524
24211491
24265227
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043044  ATP-dependent chromatin remodeling
GO:0032508  DNA duplex unwinding
GO:0001701  in utero embryonic development
GO:0043066  negative regulation of apoptosis
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0030178  negative regulation of Wnt receptor signaling pathway
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045945  positive regulation of transcription from RNA polymerase III promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0060070  Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin

Cellular Component

GO:0071339  MLL1 complex
GO:0005634  nucleus
GO:0043234  protein complex

Molecular Function

GO:0070016  armadillo repeat domain binding
GO:0005524  ATP binding
GO:0008013  beta-catenin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0003678  DNA helicase activity
GO:0008094  DNA-dependent ATPase activity
GO:0042393  histone binding
GO:0035064  methylated histone residue binding
GO:0002039  p53 binding
GO:0005515  protein binding