CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1

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同義遺伝子名

NIF3, NLI-IF, CTDSP1, NLI-interacting factor 3, Nuclear LIM interactor-interacting factor 3, NLIIF

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:9.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:224.60 網膜:- 目:135.20 動脈:89.90 静脈:66.60 リンパ節:70.80 末梢血:127.50 脾臓:56.70 胸腺:38.70 骨髄:19.70 脂肪:121 骨:64 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:6.79 小脳:6.65 脳幹:6.82 脳梁:7.32 松果体:- 末梢神経:7.45 脊柱:7.14 網膜:- 目:- 動脈:8.16 静脈:7.73 リンパ節:7.87 末梢血:- 脾臓:8.09 胸腺:7.51 骨髄:7.93 脂肪:7.98 骨:- 皮膚:7.76
CAGE 大脳:3.19 小脳:- 脳幹:3.27 脳梁:4.05 松果体:2.63 末梢神経:- 脊柱:3.40 網膜:- 目:- 動脈:4.57 静脈:4.21 リンパ節:4.14 末梢血:- 脾臓:4.17 胸腺:4.03 骨髄:- 脂肪:4.14 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.37 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.51 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.31 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:102 前立腺:112.60 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:89.40 骨格筋:60.30 食道:- 胃:63.70 腸:32.40 結腸:59.40     肝臓:-        肺:58.70    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:232 甲状腺:163.70 副腎:152.40 膵臓:26.70 乳腺:92.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.78 胎盤:9.33 前立腺:8.11 卵巣:7.79 精巣:6.76 心臓:7.58 骨格筋:7.22 食道:7.67 胃:8.02 腸:7.63 結腸:8.01 肝臓:8.11 肺:8.01 膀胱:- 腎臓:8.14 下垂体:7.20 甲状腺:8.25 副腎:7.77 膵臓:7.30 乳腺:8.12 唾液腺:7.93
CAGE 子宮:4.27 胎盤:4.87 前立腺:4.34 卵巣:4.50 精巣:3.55 心臓:4.07 骨格筋:3.61 食道:4.15 胃:- 腸:4.40 結腸:4.29     肝臓:4.39    肺:4.10 膀胱:4.03 腎臓:4.20 下垂体:2.99 甲状腺:4.35 副腎:- 膵臓:4.53 乳腺:4.49 唾液腺:4.18
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.32 卵巣:3.47 精巣:2.14 心臓:2.02 骨格筋:2.11 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.37     肝臓:2.86        肺:2.31    膀胱:- 腎臓:2.58 下垂体:- 甲状腺:3.41 副腎:2.88 膵臓:- 乳腺:2.71 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_021198
Gene ID 58190
Unigene ID Hs.444468
Probe set ID 217844_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000144579
GTEx ID ENSG00000144579

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_153088
ラット[2]  NM_001128079

染色体

2q35  [219,262,979  -  219,270,664]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011948  Dullard-like phosphatase domain
IPR004274  NLI interacting factor

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10967134
11950066
12477932
12721286
14743429
15489334
15681389
16189514
17085434
19004823
19913121
20222012
20628086
21239611
21348431
21906983
23128233
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0050768  negative regulation of neurogenesis
GO:0045665  negative regulation of neuron differentiation
GO:0006470  protein amino acid dephosphorylation
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0008420  CTD phosphatase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0005515  protein binding