Bardet-Biedl syndrome 4

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同義遺伝子名

Bardet-Biedl syndrome 4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, BBS4

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:40.30 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:237.30 目:47 動脈:30 静脈:- リンパ節:30.30 末梢血:18.20 脾臓:37.80 胸腺:25.80 骨髄:216.50 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:62.40
GeneChip 大脳:5.78 小脳:5.10 脳幹:6.20 脳梁:5.56 松果体:- 末梢神経:6.23 脊柱:5.77 網膜:- 目:- 動脈:5.87 静脈:5.44 リンパ節:5.94 末梢血:- 脾臓:5.96 胸腺:5.93 骨髄:5.02 脂肪:5.81 骨:- 皮膚:5.56
CAGE 大脳:2.62 小脳:- 脳幹:2.83 脳梁:2.92 松果体:3.61 末梢神経:- 脊柱:2.72 網膜:- 目:- 動脈:2.62 静脈:2.18 リンパ節:1.97 末梢血:- 脾臓:2.09 胸腺:2.47 骨髄:- 脂肪:2.27 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.57 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.55 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.79 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:136.70 胎盤:18.20 前立腺:78.90 卵巣:- 精巣:129.80 心臓:76.60 骨格筋:40.20 食道:- 胃:85 腸:64.80 結腸:8.50     肝臓:31.70        肺:88    膀胱:125.60 腎臓:62.40 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:101.60 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:328.40
GeneChip 子宮:6.02 胎盤:4.88 前立腺:7.29 卵巣:6.26 精巣:7.03 心臓:5.71 骨格筋:5.81 食道:5.55 胃:5.80 腸:5.20 結腸:5 肝臓:6.15 肺:5.30 膀胱:- 腎臓:6.22 下垂体:7.11 甲状腺:6.87 副腎:6.46 膵臓:5.39 乳腺:6.15 唾液腺:5.49
CAGE 子宮:2.75 胎盤:2.00 前立腺:2.62 卵巣:2.40 精巣:3.37 心臓:2.17 骨格筋:2.21 食道:2.24 胃:- 腸:2.17 結腸:2.30     肝臓:2.33    肺:2.31 膀胱:2.63 腎臓:2.63 下垂体:3.56 甲状腺:2.52 副腎:- 膵臓:2.26 乳腺:2.02 唾液腺:1.95
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.25 卵巣:2.53 精巣:3.47 心臓:2.25 骨格筋:2.02 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.64     肝臓:1.01        肺:2.37    膀胱:- 腎臓:2.74 下垂体:- 甲状腺:3.22 副腎:1.73 膵臓:- 乳腺:2.27 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_033028
Gene ID 585
Unigene ID Hs.208681
Probe set ID 212744_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000140463
GTEx ID ENSG00000140463

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_175325
ラット[1]  NM_001106826

染色体

15q24.1  [72,978,527  -  73,030,817]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019734  Tetratricopeptide repeat

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7711739
8889548
9126487
11381270
12016587
12365916
12477932
12872256
14520415
14702039
15107855
15489334
15497446
17003356
17574030
18000879
18029348
18299575
19077438
20301537
20301743
20379614
20508983
20801516
21145461
21906983
22219648
23554981
23716571
24691443

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030534  adult behavior
GO:0048854  brain morphogenesis
GO:0051297  centrosome organization
GO:0021987  cerebral cortex development
GO:0042384  cilium assembly
GO:0060271  cilium morphogenesis
GO:0060027  convergent extension involved in gastrulation
GO:0000910  cytokinesis
GO:0016358  dendrite development
GO:0045444  fat cell differentiation
GO:0001947  heart looping
GO:0021766  hippocampus development
GO:0046907  intracellular transport
GO:0051457  maintenance of protein location in nucleus
GO:0032402  melanosome transport
GO:0034454  microtubule anchoring at centrosome
GO:0000226  microtubule cytoskeleton organization
GO:0010629  negative regulation of gene expression
GO:0003085  negative regulation of systemic arterial blood pressure
GO:0001843  neural tube closure
GO:0045494  photoreceptor cell maintenance
GO:0051877  pigment granule aggregation in cell center
GO:0045724  positive regulation of flagellum assembly
GO:0040018  positive regulation of multicellular organism growth
GO:0033365  protein localization in organelle
GO:0060296  regulation of cilium beat frequency involved in ciliary motility
GO:0032465  regulation of cytokinesis
GO:0019216  regulation of lipid metabolic process
GO:0001895  retina homeostasis
GO:0046548  retinal rod cell development
GO:0035058  sensory cilium assembly
GO:0007608  sensory perception of smell
GO:0050893  sensory processing
GO:0007286  spermatid development
GO:0021756  striatum development
GO:0007601  visual perception

Cellular Component

GO:0034464  BBSome
GO:0034451  centriolar satellite
GO:0005814  centriole
GO:0005813  centrosome
GO:0060170  cilium membrane
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005932  microtubule basal body
GO:0031514  motile secondary cilium
GO:0031513  nonmotile primary cilium
GO:0000242  pericentriolar material

Molecular Function

GO:0043014  alpha-tubulin binding
GO:0048487  beta-tubulin binding
GO:0034452  dynactin binding
GO:0003777  microtubule motor activity
GO:0005515  protein binding