Bardet-Biedl syndrome 4

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同義遺伝子名

Bardet-Biedl syndrome 4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, BBS4

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:40.30 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:237.30 目:47 動脈:30 静脈:- リンパ節:30.30 末梢血:18.20 脾臓:37.80 胸腺:25.80 骨髄:216.50 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:62.40
GeneChip 大脳:4.65 小脳:4.34 脳幹:4.89 脳梁:4.76 松果体:- 末梢神経:5.21 脊柱:4.67 網膜:- 目:- 動脈:4.81 静脈:4.48 リンパ節:4.93 末梢血:- 脾臓:4.90 胸腺:4.92 骨髄:4.32 脂肪:4.67 骨:- 皮膚:4.61
CAGE 大脳:2.62 小脳:- 脳幹:2.83 脳梁:2.92 松果体:3.61 末梢神経:- 脊柱:2.72 網膜:- 目:- 動脈:2.62 静脈:2.18 リンパ節:1.97 末梢血:- 脾臓:2.09 胸腺:2.47 骨髄:- 脂肪:2.27 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.57 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.55 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.79 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:136.70 胎盤:18.20 前立腺:78.90 卵巣:- 精巣:129.80 心臓:76.60 骨格筋:40.20 食道:- 胃:85 腸:64.80 結腸:8.50     肝臓:31.70        肺:88    膀胱:125.60 腎臓:62.40 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:101.60 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:328.40
GeneChip 子宮:5.17 胎盤:4.41 前立腺:6.37 卵巣:5.39 精巣:5.89 心臓:4.62 骨格筋:4.78 食道:4.55 胃:4.85 腸:4.52 結腸:4.35 肝臓:4.96 肺:4.60 膀胱:- 腎臓:5.11 下垂体:5.79 甲状腺:5.69 副腎:5.10 膵臓:4.60 乳腺:5.09 唾液腺:4.75
CAGE 子宮:2.75 胎盤:2.00 前立腺:2.62 卵巣:2.40 精巣:3.37 心臓:2.17 骨格筋:2.21 食道:2.24 胃:- 腸:2.17 結腸:2.30     肝臓:2.33    肺:2.31 膀胱:2.63 腎臓:2.63 下垂体:3.56 甲状腺:2.52 副腎:- 膵臓:2.26 乳腺:2.02 唾液腺:1.95
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.25 卵巣:2.53 精巣:3.47 心臓:2.25 骨格筋:2.02 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.64     肝臓:1.01        肺:2.37    膀胱:- 腎臓:2.74 下垂体:- 甲状腺:3.22 副腎:1.73 膵臓:- 乳腺:2.27 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_033028
Gene ID 585
Unigene ID Hs.208681
Probe set ID 212745_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000140463
GTEx ID ENSG00000140463

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_175325
ラット[1]  NM_001106826

染色体

15q24.1  [72,978,527  -  73,030,817]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019734  Tetratricopeptide repeat

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7711739
8889548
9126487
11381270
12016587
12365916
12477932
12872256
14520415
14702039
15107855
15489334
15497446
17003356
17574030
18000879
18029348
18299575
19077438
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20301743
20379614
20508983
20801516
21145461
21906983
22219648
23554981
23716571
24691443

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030534  adult behavior
GO:0048854  brain morphogenesis
GO:0051297  centrosome organization
GO:0021987  cerebral cortex development
GO:0042384  cilium assembly
GO:0060271  cilium morphogenesis
GO:0060027  convergent extension involved in gastrulation
GO:0000910  cytokinesis
GO:0016358  dendrite development
GO:0045444  fat cell differentiation
GO:0001947  heart looping
GO:0021766  hippocampus development
GO:0046907  intracellular transport
GO:0051457  maintenance of protein location in nucleus
GO:0032402  melanosome transport
GO:0034454  microtubule anchoring at centrosome
GO:0000226  microtubule cytoskeleton organization
GO:0010629  negative regulation of gene expression
GO:0003085  negative regulation of systemic arterial blood pressure
GO:0001843  neural tube closure
GO:0045494  photoreceptor cell maintenance
GO:0051877  pigment granule aggregation in cell center
GO:0045724  positive regulation of flagellum assembly
GO:0040018  positive regulation of multicellular organism growth
GO:0033365  protein localization in organelle
GO:0060296  regulation of cilium beat frequency involved in ciliary motility
GO:0032465  regulation of cytokinesis
GO:0019216  regulation of lipid metabolic process
GO:0001895  retina homeostasis
GO:0046548  retinal rod cell development
GO:0035058  sensory cilium assembly
GO:0007608  sensory perception of smell
GO:0050893  sensory processing
GO:0007286  spermatid development
GO:0021756  striatum development
GO:0007601  visual perception

Cellular Component

GO:0034464  BBSome
GO:0034451  centriolar satellite
GO:0005814  centriole
GO:0005813  centrosome
GO:0060170  cilium membrane
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005932  microtubule basal body
GO:0031514  motile secondary cilium
GO:0031513  nonmotile primary cilium
GO:0000242  pericentriolar material

Molecular Function

GO:0043014  alpha-tubulin binding
GO:0048487  beta-tubulin binding
GO:0034452  dynactin binding
GO:0003777  microtubule motor activity
GO:0005515  protein binding