sorting nexin 6

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同義遺伝子名

sorting nexin 6, MGC3157, SNX6, Sorting nexin-6, TRAF4-associated factor 2, MSTP010, TFAF2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.21 小脳:6.41 脳幹:7.43 脳梁:7.93 松果体:- 末梢神経:7.64 脊柱:7.67 網膜:- 目:- 動脈:7.88 静脈:7.66 リンパ節:7.73 末梢血:- 脾臓:7.65 胸腺:7.65 骨髄:6.77 脂肪:7.76 骨:- 皮膚:7.64
CAGE 大脳:3.49 小脳:- 脳幹:3.90 脳梁:4.08 松果体:3.33 末梢神経:- 脊柱:3.96 網膜:- 目:- 動脈:3.59 静脈:3.84 リンパ節:3.91 末梢血:- 脾臓:4.13 胸腺:3.79 骨髄:- 脂肪:4.22 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.89 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.66 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:7.50 胎盤:7.78 前立腺:7.34 卵巣:7.58 精巣:7.43 心臓:6.98 骨格筋:7.03 食道:7.38 胃:7.17 腸:7.20 結腸:7.09 肝臓:7.09 肺:7.53 膀胱:- 腎臓:6.87 下垂体:6.52 甲状腺:7.23 副腎:7.50 膵臓:6.70 乳腺:7.70 唾液腺:6.64
CAGE 子宮:4.04 胎盤:4.36 前立腺:3.82 卵巣:3.67 精巣:3.93 心臓:3.64 骨格筋:3.07 食道:3.83 胃:- 腸:4.22 結腸:3.62     肝臓:3.38    肺:3.73 膀胱:3.59 腎臓:3.96 下垂体:3.45 甲状腺:3.63 副腎:- 膵臓:3.40 乳腺:4.03 唾液腺:3.76
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.05 卵巣:4.83 精巣:5.08 心臓:4.23 骨格筋:4.22 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.80     肝臓:3.55        肺:4.23    膀胱:- 腎臓:4.96 下垂体:- 甲状腺:4.59 副腎:4.77 膵臓:- 乳腺:5.01 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_152233
Gene ID 58533
Unigene ID -
Probe set ID 217789_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000129515
GTEx ID ENSG00000129515

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_026998
ラット[1]  NM_001108711

染色体

14q13.1  [35,030,300  -  35,099,389]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11278302
11279102
11485546
11591366
12477932
14702039
15840729
16713569
16730713
17043677
17148574
18029348
18523162
19322201
19935774
20354142
20830743
21139048
21890473
21906983
21988832
22053931
22505724
22863883
22939629
22990118
23000965
23936387
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007154  cell communication
GO:0006886  intracellular protein transport
GO:0007175  negative regulation of epidermal growth factor receptor activity
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0030512  negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
GO:0042147  retrograde transport, endosome to Golgi

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0030659  cytoplasmic vesicle membrane
GO:0031901  early endosome membrane
GO:0005622  intracellular
GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0035091  phosphoinositide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0042803  protein homodimerization activity