retinoblastoma binding protein 4

同義遺伝子名

CAF-I p48, Nucleosome remodeling factor subunit RBAP48, RBBP4, CAF-I 48 kDa subunit, RBBP-4, RBAP48, Retinoblastoma-binding protein 4, RbAp48, retinoblastoma binding protein 4, Chromatin assembly factor 1 subunit C, retinoblastoma-binding protein 4, CAF-1 subunit C, NURF55, Chromatin assembly factor I p48 subunit, Histone-binding protein RBBP4, Retinoblastoma-binding protein p48

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:29.60

小脳:50.40

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:-

目:82.30

動脈:60

静脈:66.60

リンパ節:70.80

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:25.80

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:12.80

皮膚:38.40

GeneChip

大脳:7.54

小脳:7.20

脳幹:7.58

脳梁:8.16

松果体:-

末梢神経:7.86

脊柱:8.28

網膜:-

目:-

動脈:7.27

静脈:7.57

リンパ節:8.30

末梢血:-

脾臓:7.98

胸腺:9.82

骨髄:8.44

脂肪:7.81

骨:-

皮膚:7.36

CAGE

大脳:4.38

小脳:-

脳幹:4.43

脳梁:4.59

松果体:5.15

末梢神経:-

脊柱:4.46

網膜:-

目:-

動脈:4.16

静脈:4.43

リンパ節:4.46

末梢血:-

脾臓:4.25

胸腺:5.19

骨髄:-

脂肪:4.25

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:36.50

胎盤:29.10

前立腺:45.10

卵巣:-

精巣:38.90

心臓:63.90

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:64.80

結腸:59.40

肝臓:52.80

肺:48.90

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:97.80

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.49

胎盤:8.07

前立腺:8.28

卵巣:8.75

精巣:9.54

心臓:7.78

骨格筋:6.91

食道:7.64

胃:7.87

腸:8

結腸:8.09

肝臓:6.94

肺:7.91

膀胱:-

腎臓:7.74

下垂体:8.27

甲状腺:8.35

副腎:7.88

膵臓:7.56

乳腺:8.19

唾液腺:8.48

CAGE

子宮:4.30

胎盤:4.28

前立腺:4.23

卵巣:4.49

精巣:4.74

心臓:4.23

骨格筋:4.14

食道:4.01

胃:-

腸:4.10

結腸:4.19

肝臓:4.09

肺:4.18

膀胱:4.14

腎臓:4.19

下垂体:4.62

甲状腺:4.49

副腎:-

膵臓:4.26

乳腺:4.20

唾液腺:4.48

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.00

精巣:0.04

心臓:0.27

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.83

肝臓:0.31

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.24

下垂体:-

甲状腺:0.96

副腎:0.03

膵臓:-

乳腺:0.06

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001135255
Gene ID	5928
Unigene ID	Hs.16003
Probe set ID	210371_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000162521
GTEx ID	ENSG00000162521

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_009030
ラット[3]	NM_009030

染色体

1p35.1 [33,116,743 - 33,146,258]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472	G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680	WD40 repeat
IPR019782	WD40 repeat 2
IPR019781	WD40 repeat, subgroup
IPR011046	WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986	WD40-repeat-containing domain
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain

GO:0034080	CenH3-containing nucleosome assembly at centromere
GO:0031497	chromatin assembly
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0006260	DNA replication
GO:0000278	mitotic cell cycle
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0006334	nucleosome assembly
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

GO:0033186	CAF-1 complex
GO:0035098	ESC/E(Z) complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0016581	NuRD complex
GO:0016589	NURF complex
GO:0016580	Sin3 complex

GO:0008094	DNA-dependent ATPase activity
GO:0042393	histone binding
GO:0042826	histone deacetylase binding
GO:0005515	protein binding

retinoblastoma binding protein 4

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function