RNA binding motif, single stranded interacting protein 1

同義遺伝子名

MGC3331, MSSP-1, Suppressor of CDC2 with RNA-binding motif 2, RBMS1, MSSP, YC1, Single-stranded DNA-binding protein MSSP-1, MGC15146, MSSP-3, SCR2, MSSP-2, MSSP1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:29.60

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:148.30

末梢神経:153.40

脊柱:224.60

網膜:237.30

目:35.30

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:121.30

末梢血:54.70

脾臓:56.70

胸腺:141.70

骨髄:177.10

脂肪:161.30

骨:64

皮膚:153.60

GeneChip

大脳:6.65

小脳:5.56

脳幹:7.16

脳梁:6.38

松果体:-

末梢神経:9.03

脊柱:7.35

網膜:-

目:-

動脈:9.10

静脈:8.79

リンパ節:8.75

末梢血:-

脾臓:9.49

胸腺:9.15

骨髄:8.64

脂肪:9.11

骨:-

皮膚:8.95

CAGE

大脳:2.28

小脳:-

脳幹:2.39

脳梁:1.91

松果体:2.78

末梢神経:-

脊柱:2.57

網膜:-

目:-

動脈:3.78

静脈:3.58

リンパ節:3.30

末梢血:-

脾臓:3.66

胸腺:2.99

骨髄:-

脂肪:4.16

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.63

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.27

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.92

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:227.80

胎盤:324.20

前立腺:78.90

卵巣:111.80

精巣:34.60

心臓:153.30

骨格筋:60.30

食道:-

胃:977.10

腸:-

結腸:93.30

肝臓:126.70

肺:200.40

膀胱:-

腎臓:197.50

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:80

乳腺:102.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:9.42

胎盤:10.23

前立腺:8.71

卵巣:9.10

精巣:7.14

心臓:9.05

骨格筋:6.97

食道:8.81

胃:8.52

腸:7.95

結腸:7.59

肝臓:8.11

肺:9.27

膀胱:-

腎臓:8.33

下垂体:7.54

甲状腺:8.42

副腎:8.61

膵臓:6.41

乳腺:9.23

唾液腺:7.42

CAGE

子宮:4.21

胎盤:5.14

前立腺:3.80

卵巣:3.82

精巣:2.64

心臓:4.15

骨格筋:2.65

食道:3.59

胃:-

腸:2.85

結腸:3.33

肝臓:2.69

肺:4.01

膀胱:3.96

腎臓:3.60

下垂体:3.47

甲状腺:2.99

副腎:-

膵臓:2.26

乳腺:3.93

唾液腺:2.95

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.94

卵巣:0.71

精巣:0.84

心臓:0.65

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.81

肝臓:0.00

肺:1.34

膀胱:-

腎臓:0.75

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:0.74

膵臓:-

乳腺:1.43

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_016836
Gene ID	5937
Unigene ID	Hs.470412
Probe set ID	215127_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000153250
GTEx ID	ENSG00000153250

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001141931, NM_001141932, NM_020296
ラット[1]	NM_001012184, NM_001141932, NM_020296

染色体

2q24.2 [161,128,662 - 161,350,305]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002343	Paraneoplastic encephalomyelitis antigen
IPR000504	RNA recognition motif, RNP-1

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006260	DNA replication
GO:0006396	RNA processing

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding
GO:0003697	single-stranded DNA binding

RNA binding motif, single stranded interacting protein 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function