opsin 1 (cone pigments), long-wave-sensitive

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同義遺伝子名

Red-sensitive opsin, Red cone photoreceptor pigment, CBBM, OPN1LW

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:52.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:4.56

小脳:4.67

脳幹:4.57

脳梁:4.54

松果体:-

末梢神経:4.26

脊柱:4.49

網膜:-

目:-

動脈:4.53

静脈:4.69

リンパ節:4.50

末梢血:-

脾臓:4.40

胸腺:4.10

骨髄:4.68

脂肪:4.49

骨:-

皮膚:4.72

CAGE

大脳:0

小脳:-

脳幹:0

脳梁:0

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.05

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.01

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.42

胎盤:4.47

前立腺:4.35

卵巣:4.44

精巣:4.28

心臓:4.70

骨格筋:4.91

食道:4.66

胃:4.50

腸:4.75

結腸:4.55

肝臓:4.64

肺:4.63

膀胱:-

腎臓:4.44

下垂体:4.47

甲状腺:4.62

副腎:4.55

膵臓:4.94

乳腺:4.57

唾液腺:4.50

CAGE

子宮:0

胎盤:0

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0

心臓:0

骨格筋:0

食道:0

胃:-

腸:0

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:0

腎臓:0

下垂体:0

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.04

卵巣:0.01

精巣:0.04

心臓:0

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0

副腎:0.14

膵臓:-

乳腺:0.02

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_020061
Gene ID	5956
Unigene ID	Hs.592247
Probe set ID	221327_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000102076
GTEx ID	ENSG00000102076

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008106
ラット [0]

染色体

Xq28 [153,409,698 - 153,424,507]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000276	7TM GPCR, rhodopsin-like
IPR017452	GPCR, rhodopsin-like superfamily
IPR001760	Opsin
IPR000378	Opsin, red/green sensitive

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007603	phototransduction, visible light
GO:0018298	protein-chromophore linkage
GO:0001523	retinoid metabolic process
GO:0007165	signal transduction
GO:0007601	visual perception

Cellular Component

GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0042622	photoreceptor outer segment membrane

Molecular Function

GO:0004930	G-protein coupled receptor activity
GO:0009881	photoreceptor activity

opsin 1 (cone pigments), long-wave-sensitive

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function