UPF1 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast)

同義遺伝子名

KIAA0221, FLJ43809, ATP-dependent helicase RENT1, NORF1, pNORF1, hUpf1, Regulator of nonsense transcripts 1, Up-frameshift suppressor 1 homolog, FLJ46894, Nonsense mRNA reducing factor 1, RENT1, regulator of nonsense transcripts 1, UPF1, HUPF1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:46.20

小脳:100.80

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:118.60

目:99.90

動脈:60

静脈:-

リンパ節:121.30

末梢血:109.30

脾臓:56.70

胸腺:38.70

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:38.40

皮膚:100.80

GeneChip

大脳:5.40

小脳:5.18

脳幹:5.52

脳梁:5.12

松果体:-

末梢神経:5.07

脊柱:5.12

網膜:-

目:-

動脈:5.48

静脈:5.58

リンパ節:5.48

末梢血:-

脾臓:5.60

胸腺:5.18

骨髄:5.24

脂肪:5.48

骨:-

皮膚:5.54

CAGE

大脳:3.84

小脳:-

脳幹:3.79

脳梁:4.10

松果体:3.65

末梢神経:-

脊柱:3.55

網膜:-

目:-

動脈:3.75

静脈:3.99

リンパ節:3.79

末梢血:-

脾臓:3.80

胸腺:3.95

骨髄:-

脂肪:4.05

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.27

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.15

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:134.80

前立腺:67.60

卵巣:-

精巣:164.40

心臓:76.60

骨格筋:40.20

食道:-

胃:63.70

腸:32.40

結腸:127.20

肝臓:95

肺:127.10

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:62.20

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.28

胎盤:4.75

前立腺:5.86

卵巣:5.27

精巣:6.95

心臓:5.33

骨格筋:5.42

食道:5.58

胃:5.46

腸:5.30

結腸:5.54

肝臓:5.64

肺:5.25

膀胱:-

腎臓:5.61

下垂体:5.60

甲状腺:5.59

副腎:5.85

膵臓:5.35

乳腺:5.29

唾液腺:5.96

CAGE

子宮:3.98

胎盤:4.17

前立腺:4.02

卵巣:3.91

精巣:4.50

心臓:3.58

骨格筋:3.44

食道:3.94

胃:-

腸:3.72

結腸:4.04

肝臓:3.75

肺:3.81

膀胱:3.80

腎臓:3.71

下垂体:3.84

甲状腺:4.07

副腎:-

膵臓:4.26

乳腺:3.64

唾液腺:4.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.11

卵巣:3.91

精巣:4.55

心臓:2.52

骨格筋:3.73

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.87

肝臓:2.99

肺:4.17

膀胱:-

腎臓:3.74

下垂体:-

甲状腺:4.09

副腎:3.73

膵臓:-

乳腺:3.07

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002911
Gene ID	5976
Unigene ID	Hs.515266
Probe set ID	208947_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000005007
GTEx ID	ENSG00000005007

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001122829, NM_030680
ラット[2]	NM_001122829, NM_030680

染色体

19p13.11 [18,942,744 - 18,979,038]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007049	cell cycle
GO:0006281	DNA repair
GO:0006260	DNA replication
GO:0009048	dosage compensation, by inactivation of X chromosome
GO:0010467	gene expression
GO:0071044	histone mRNA catabolic process
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0016071	mRNA metabolic process
GO:0000184	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0006449	regulation of translational termination
GO:0016070	RNA metabolic process

Cellular Component

GO:0000785	chromatin
GO:0005737	cytoplasm
GO:0000932	cytoplasmic mRNA processing body
GO:0005829	cytosol
GO:0035145	exon-exon junction complex
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0004004	ATP-dependent RNA helicase activity
GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0004386	helicase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding
GO:0008270	zinc ion binding

UPF1 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function