rhodopsin

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同義遺伝子名

RP4, Opsin-2, RHO, MGC138311, OPN2, MGC138309, Rhodopsin

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:1186.40

目:2021.70

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:5.42

小脳:5.27

脳幹:5.46

脳梁:5.38

松果体:-

末梢神経:5.25

脊柱:5.36

網膜:-

目:-

動脈:5.32

静脈:5.47

リンパ節:5.14

末梢血:-

脾臓:5.19

胸腺:5.12

骨髄:5.48

脂肪:5.38

骨:-

皮膚:5.25

CAGE

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:0

脳梁:0.07

松果体:0.72

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.04

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.13

胎盤:5.12

前立腺:5.12

卵巣:5.11

精巣:5.21

心臓:5.44

骨格筋:5.51

食道:5.26

胃:5.33

腸:5.45

結腸:5.60

肝臓:5.54

肺:5.24

膀胱:-

腎臓:5.38

下垂体:5.38

甲状腺:5.10

副腎:5.26

膵臓:5.40

乳腺:5.03

唾液腺:5.52

CAGE

子宮:0

胎盤:0

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0

心臓:0

骨格筋:0

食道:0

胃:-

腸:0

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:0

腎臓:0

下垂体:0

甲状腺:0.41

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.02

卵巣:0.03

精巣:0.01

心臓:0.00

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0

副腎:0

膵臓:-

乳腺:0.08

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000539
Gene ID	6010
Unigene ID	Hs.247565
Probe set ID	206455_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000163914
GTEx ID	ENSG00000163914

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_145383
ラット [0]

染色体

3q22.1 [129,247,483 - 129,254,012]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000276	7TM GPCR, rhodopsin-like
IPR017452	GPCR, rhodopsin-like superfamily
IPR001760	Opsin
IPR000732	Rhodopsin

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007186	G-protein coupled receptor protein signaling pathway
GO:0007603	phototransduction, visible light
GO:0006468	protein amino acid phosphorylation
GO:0018298	protein-chromophore linkage
GO:0009585	red, far-red light phototransduction
GO:0022400	regulation of rhodopsin mediated signaling pathway
GO:0060041	retina development in camera-type eye
GO:0001523	retinoid metabolic process
GO:0016056	rhodopsin mediated signaling pathway
GO:0007601	visual perception

Cellular Component

GO:0005794	Golgi apparatus
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0001917	photoreceptor inner segment
GO:0060342	photoreceptor inner segment membrane
GO:0001750	photoreceptor outer segment
GO:0042622	photoreceptor outer segment membrane
GO:0005886	plasma membrane
GO:0030867	rough endoplasmic reticulum membrane

Molecular Function

GO:0004930	G-protein coupled receptor activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0009881	photoreceptor activity
GO:0005515	protein binding
GO:0016918	retinal binding

rhodopsin

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function