retinoid X receptor, beta

同義遺伝子名

retinoid X receptor, beta, Retinoic acid receptor RXR-beta, NR2B2, MGC1831, H-2RIIBP, RCoR-1, DAUDI6, RXRB, Retinoid X receptor beta

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:56.90

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:64.60

動脈:30

静脈:-

リンパ節:70.80

末梢血:109.30

脾臓:37.80

胸腺:51.50

骨髄:-

脂肪:-

骨:38.40

皮膚:38.40

GeneChip

大脳:7.53

小脳:7.82

脳幹:7.38

脳梁:7.52

松果体:-

末梢神経:7.51

脊柱:7.36

網膜:-

目:-

動脈:7.64

静脈:7.58

リンパ節:7.78

末梢血:-

脾臓:7.74

胸腺:7.62

骨髄:7.42

脂肪:7.59

骨:-

皮膚:7.46

CAGE

大脳:3.79

小脳:-

脳幹:3.74

脳梁:3.89

松果体:3.40

末梢神経:-

脊柱:3.44

網膜:-

目:-

動脈:3.75

静脈:3.71

リンパ節:3.44

末梢血:-

脾臓:3.39

胸腺:3.72

骨髄:-

脂肪:3.88

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:47.40

前立腺:67.60

卵巣:74.50

精巣:51.90

心臓:127.70

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:25.40

肝臓:73.90

肺:14.70

膀胱:-

腎臓:62.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:152.40

膵臓:62.20

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.59

胎盤:7.55

前立腺:7.44

卵巣:7.58

精巣:7.11

心臓:7.16

骨格筋:7.40

食道:7.65

胃:7.51

腸:7.20

結腸:7.55

肝臓:7.56

肺:7.74

膀胱:-

腎臓:7.54

下垂体:7.70

甲状腺:7.99

副腎:7.60

膵臓:7.24

乳腺:7.77

唾液腺:7.42

CAGE

子宮:3.92

胎盤:3.87

前立腺:3.95

卵巣:3.69

精巣:3.53

心臓:3.49

骨格筋:3.67

食道:3.60

胃:-

腸:3.32

結腸:3.84

肝臓:3.55

肺:3.52

膀胱:3.65

腎臓:3.39

下垂体:3.73

甲状腺:4.01

副腎:-

膵臓:3.45

乳腺:3.33

唾液腺:3.67

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0

心臓:0

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0

副腎:0

膵臓:-

乳腺:0

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_021976
Gene ID	6257
Unigene ID	Hs.388034
Probe set ID	209148_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000204231 ENSG00000228333
GTEx ID	ENSG00000204231 ENSG00000228333

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001205214, NM_001205215, NM_001205216, NM_011306
ラット [0]

染色体

6p21.32 [33,161,365 - 33,168,630]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_COX [33,082,997 - 33,090,260]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_QBL [33,090,190 - 33,097,456]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_MCF [33,331,732 - 33,338,994]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_DBB [33,139,275 - 33,146,540]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_MANN [33,315,284 - 33,322,549]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003078	Retinoic acid receptor
IPR000003	Retinoid X receptor
IPR001723	Steroid hormone receptor
IPR003068	Transcription factor COUP
IPR013088	Zinc finger, NHR/GATA-type
IPR001628	Zinc finger, nuclear hormone receptor-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0060038	cardiac muscle cell proliferation
GO:0071300	cellular response to retinoic acid
GO:0010467	gene expression
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0001893	maternal placenta development
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006367	transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0055012	ventricular cardiac muscle cell differentiation

Cellular Component

GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0004879	ligand-dependent nuclear receptor activity
GO:0005515	protein binding
GO:0004886	retinoid-X receptor activity
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003707	steroid hormone receptor activity
GO:0003713	transcription coactivator activity
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008270	zinc ion binding

retinoid X receptor, beta

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function