S100 calcium binding protein A12

同義遺伝子名

S100A12, S100 calcium-binding protein A12, Calcium-binding protein in amniotic fluid 1, CAAF1, S100 calcium binding protein A12 (calgranulin C), CGRP, Protein S100-A12, S100 calcium binding protein A12, S100 calcium-binding protein A12 (calgranulin C), CAGC, MRP6, Calgranulin-C, ENRAGE, p6, Neutrophil S100 protein

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:18.20

脾臓:18.90

胸腺:-

骨髄:413.30

脂肪:40.30

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:3.52

小脳:3.40

脳幹:3.78

脳梁:3.39

松果体:-

末梢神経:3.33

脊柱:3.60

網膜:-

目:-

動脈:3.52

静脈:3.82

リンパ節:4.59

末梢血:-

脾臓:6.13

胸腺:5.74

骨髄:12.29

脂肪:3.82

骨:-

皮膚:4.77

CAGE

大脳:1.12

小脳:-

脳幹:1.67

脳梁:0.88

松果体:1.31

末梢神経:-

脊柱:1.51

網膜:-

目:-

動脈:1.65

静脈:1.86

リンパ節:3.58

末梢血:-

脾臓:5.51

胸腺:2.50

骨髄:-

脂肪:2.89

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.29

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.81

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:7.09

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:38.30

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:25.40

肝臓:10.60

肺:-

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.60

胎盤:3.80

前立腺:3.36

卵巣:3.29

精巣:3.34

心臓:3.79

骨格筋:3.52

食道:6.92

胃:3.52

腸:3.62

結腸:5.97

肝臓:3.79

肺:5.27

膀胱:-

腎臓:3.51

下垂体:3.47

甲状腺:3.42

副腎:3.41

膵臓:3.70

乳腺:3.32

唾液腺:3.62

CAGE

子宮:1.73

胎盤:2.58

前立腺:1.40

卵巣:1.86

精巣:1.78

心臓:2.85

骨格筋:1.52

食道:3.40

胃:-

腸:1.22

結腸:0.85

肝臓:2.52

肺:3.93

膀胱:1.27

腎臓:1.61

下垂体:1.21

甲状腺:2.71

副腎:-

膵臓:2.90

乳腺:0.55

唾液腺:0.83

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.53

卵巣:1.70

精巣:4.05

心臓:2.13

骨格筋:1.14

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.93

肝臓:3.46

肺:7.42

膀胱:-

腎臓:1.90

下垂体:-

甲状腺:0.89

副腎:3.24

膵臓:-

乳腺:0.14

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005621
Gene ID	6283
Unigene ID	Hs.19413
Probe set ID	205863_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000163221
GTEx ID	ENSG00000163221

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]
ラット [0]

染色体

1q21.3 [153,346,184 - 153,348,125]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR018249

EF-HAND 2

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0050663	cytokine secretion
GO:0042742	defense response to bacterium
GO:0050832	defense response to fungus
GO:0006954	inflammatory response
GO:0045087	innate immune response
GO:0031640	killing of cells of another organism
GO:0045576	mast cell activation
GO:0002548	monocyte chemotaxis
GO:0030593	neutrophil chemotaxis
GO:0043123	positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade
GO:0050729	positive regulation of inflammatory response
GO:0043406	positive regulation of MAP kinase activity
GO:0051092	positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
GO:0006805	xenobiotic metabolic process

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005856	cytoskeleton
GO:0005829	cytosol
GO:0005576	extracellular region
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509	calcium ion binding
GO:0005507	copper ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0050786	RAGE receptor binding
GO:0008270	zinc ion binding

S100 calcium binding protein A12

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function