ataxin 1

詳細情報を見る

同義遺伝子名

ATXN1, SCA1, Spinocerebellar ataxia type 1 protein, ATX1, ataxin 1, D6S504E, Ataxin-1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:75.80

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:61.30

脊柱:224.60

網膜:711.80

目:111.70

動脈:89.90

静脈:133.30

リンパ節:91

末梢血:36.40

脾臓:18.90

胸腺:167.50

骨髄:393.60

脂肪:80.70

骨:25.60

皮膚:96

GeneChip

大脳:7.70

小脳:7.23

脳幹:7.14

脳梁:7.38

松果体:-

末梢神経:6.31

脊柱:6.94

網膜:-

目:-

動脈:6.92

静脈:7.21

リンパ節:6.19

末梢血:-

脾臓:6.90

胸腺:5.84

骨髄:5.78

脂肪:6.30

骨:-

皮膚:6.36

CAGE

大脳:4.48

小脳:-

脳幹:4.31

脳梁:4.28

松果体:4.25

末梢神経:-

脊柱:4.72

網膜:-

目:-

動脈:4.58

静脈:3.62

リンパ節:3.94

末梢血:-

脾臓:3.82

胸腺:3.19

骨髄:-

脂肪:3.57

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.76

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.50

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.82

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:218.70

胎盤:36.40

前立腺:202.80

卵巣:260.80

精巣:47.60

心臓:102.20

骨格筋:80.40

食道:-

胃:106.20

腸:-

結腸:110.20

肝臓:95

肺:102.60

膀胱:-

腎臓:135.20

下垂体:232

甲状腺:163.70

副腎:50.80

膵臓:26.70

乳腺:371.70

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.05

胎盤:6.03

前立腺:7.40

卵巣:7.23

精巣:5.61

心臓:6.40

骨格筋:7.66

食道:6.30

胃:6.89

腸:6.76

結腸:6.21

肝臓:6.58

肺:6.83

膀胱:-

腎臓:6.25

下垂体:6.54

甲状腺:7.16

副腎:6.02

膵臓:4.83

乳腺:6.86

唾液腺:6.03

CAGE

子宮:4.49

胎盤:2.97

前立腺:3.72

卵巣:3.27

精巣:3.71

心臓:3.61

骨格筋:3.69

食道:3.69

胃:-

腸:3.44

結腸:3.73

肝臓:2.92

肺:4.28

膀胱:4.10

腎臓:3.24

下垂体:4.07

甲状腺:3.84

副腎:-

膵臓:3.29

乳腺:3.69

唾液腺:3.77

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.40

卵巣:2.37

精巣:2.37

心臓:2.29

骨格筋:2.78

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.30

肝臓:1.38

肺:2.71

膀胱:-

腎臓:1.95

下垂体:-

甲状腺:2.60

副腎:1.94

膵臓:-

乳腺:2.07

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001128164
Gene ID	6310
Unigene ID	Hs.434961
Probe set ID	203232_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000124788
GTEx ID	ENSG00000124788

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_001199304, NM_001199305, NM_009124
ラット [0]

染色体

6p22.3 [16,299,343 - 16,761,722]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003652	Ataxin, AXH domain
IPR013723	Ataxin-1/HBP1 module (AXH)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008344	adult locomotory behavior
GO:0008219	cell death
GO:0043569	negative regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway
GO:0042326	negative regulation of phosphorylation
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0051168	nuclear export
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0060079	regulation of excitatory postsynaptic membrane potential
GO:0006396	RNA processing
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0008542	visual learning

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0042405	nuclear inclusion body
GO:0016363	nuclear matrix
GO:0042272	nuclear RNA export factor complex
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0042802	identical protein binding
GO:0034046	poly(G) RNA binding
GO:0008266	poly(U) RNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding
GO:0043621	protein self-association

ataxin 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function