syndecan 4

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同義遺伝子名

syndecan 4 (amphiglycan, ryudocan), Ryudocan core protein, MGC22217, Syndecan-4 precursor, SDC4, Amphiglycan, SYND4

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:35.60

小脳:-

脳幹:-

脳梁:116.60

松果体:148.30

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:41.10

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:18.90

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:25.60

皮膚:96

GeneChip

大脳:7.92

小脳:5.66

脳幹:8.16

脳梁:7.67

松果体:-

末梢神経:7.24

脊柱:8.33

網膜:-

目:-

動脈:8.33

静脈:8.89

リンパ節:7.24

末梢血:-

脾臓:6.50

胸腺:5.47

骨髄:4.71

脂肪:7

骨:-

皮膚:8.91

CAGE

大脳:4.58

小脳:-

脳幹:4.23

脳梁:4.63

松果体:4.87

末梢神経:-

脊柱:4.96

網膜:-

目:-

動脈:5.35

静脈:4.04

リンパ節:4.05

末梢血:-

脾臓:3.68

胸腺:2.46

骨髄:-

脂肪:4.45

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:6.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.69

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:6.13

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:91.10

胎盤:40.10

前立腺:90.10

卵巣:37.30

精巣:38.90

心臓:63.90

骨格筋:-

食道:-

胃:63.70

腸:64.80

結腸:76.30

肝臓:31.70

肺:141.70

膀胱:753.70

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:71.10

乳腺:46.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.55

胎盤:7.50

前立腺:8.32

卵巣:8.05

精巣:8.70

心臓:7.82

骨格筋:7.90

食道:8.72

胃:8.55

腸:7.74

結腸:7.75

肝臓:8.91

肺:9.39

膀胱:-

腎臓:9.30

下垂体:7.09

甲状腺:8.11

副腎:8.54

膵臓:7.42

乳腺:9.31

唾液腺:8.79

CAGE

子宮:4.35

胎盤:4.69

前立腺:4.69

卵巣:4.36

精巣:5.21

心臓:4.40

骨格筋:4.58

食道:5.37

胃:-

腸:4.28

結腸:4.85

肝臓:5.90

肺:5.67

膀胱:5.17

腎臓:5.63

下垂体:3.77

甲状腺:4.84

副腎:-

膵臓:5.15

乳腺:4.77

唾液腺:5.62

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:6.39

卵巣:5.32

精巣:5.55

心臓:5.16

骨格筋:5.50

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.81

肝臓:6.76

肺:7.41

膀胱:-

腎臓:6.98

下垂体:-

甲状腺:6.26

副腎:4.98

膵臓:-

乳腺:5.35

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002999
Gene ID	6385
Unigene ID	Hs.632267
Probe set ID	202071_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000124145
GTEx ID	ENSG00000124145

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_011521
ラット [0]

染色体

20q13.12 [43,953,928 - 43,977,064]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008150	biological_process
GO:0005975	carbohydrate metabolic process
GO:0030204	chondroitin sulfate metabolic process
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0006024	glycosaminoglycan biosynthetic process
GO:0006027	glycosaminoglycan catabolic process
GO:0030203	glycosaminoglycan metabolic process
GO:0007603	phototransduction, visible light
GO:0051894	positive regulation of focal adhesion formation
GO:0045860	positive regulation of protein kinase activity
GO:0051496	positive regulation of stress fiber formation
GO:0001523	retinoid metabolic process
GO:0001657	ureteric bud development

Cellular Component

GO:0009986	cell surface
GO:0043034	costamere
GO:0005576	extracellular region
GO:0005925	focal adhesion
GO:0005796	Golgi lumen
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0043202	lysosomal lumen
GO:0045121	membrane raft
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0008092	cytoskeletal protein binding
GO:0001968	fibronectin binding
GO:0005515	protein binding
GO:0005080	protein kinase C binding
GO:0070053	thrombospondin receptor activity

syndecan 4

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function