SEC13 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

SEC13-related protein, SEC13-like protein 1, SEC13 (S. cerevisiae)-like 1, SEC13L1, D3S1231E, SEC13R, SEC13-like 1 (S. cerevisiae)

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:73.50

小脳:88.20

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:118.60

目:70.50

動脈:209.80

静脈:133.30

リンパ節:50.60

末梢血:127.50

脾臓:56.70

胸腺:38.70

骨髄:177.10

脂肪:201.70

骨:76.80

皮膚:259.20

GeneChip

大脳:7.79

小脳:7.85

脳幹:7.81

脳梁:8.02

松果体:-

末梢神経:8.08

脊柱:8

網膜:-

目:-

動脈:8.31

静脈:8.45

リンパ節:8.16

末梢血:-

脾臓:7.89

胸腺:8.15

骨髄:7.90

脂肪:8.32

骨:-

皮膚:8.38

CAGE

大脳:3.48

小脳:-

脳幹:3.55

脳梁:3.60

松果体:3.21

末梢神経:-

脊柱:3.27

網膜:-

目:-

動脈:3.99

静脈:3.68

リンパ節:3.62

末梢血:-

脾臓:3.66

胸腺:3.66

骨髄:-

脂肪:3.71

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.08

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.31

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.76

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:82

胎盤:109.30

前立腺:56.30

卵巣:37.30

精巣:73.50

心臓:102.20

骨格筋:40.20

食道:-

胃:85

腸:129.60

結腸:93.30

肝臓:84.40

肺:92.90

膀胱:251.20

腎臓:114.40

下垂体:347.90

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:142.30

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.59

胎盤:8.55

前立腺:8.48

卵巣:8.63

精巣:8.32

心臓:8.02

骨格筋:8.54

食道:8.64

胃:8.33

腸:8.73

結腸:8.36

肝臓:8.13

肺:8.31

膀胱:-

腎臓:8.32

下垂体:9.11

甲状腺:8.34

副腎:8.24

膵臓:8.81

乳腺:8.44

唾液腺:8.87

CAGE

子宮:3.81

胎盤:4.16

前立腺:3.61

卵巣:3.67

精巣:3.90

心臓:3.63

骨格筋:3.72

食道:3.71

胃:-

腸:4.49

結腸:4.25

肝臓:4.36

肺:3.80

膀胱:3.65

腎臓:3.92

下垂体:4.39

甲状腺:4.03

副腎:-

膵臓:4.58

乳腺:3.69

唾液腺:4.55

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.25

卵巣:5.07

精巣:5.14

心臓:3.97

骨格筋:5.73

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.56

肝臓:5.29

肺:5.31

膀胱:-

腎臓:5.23

下垂体:-

甲状腺:5.08

副腎:5.17

膵臓:-

乳腺:4.79

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_183352
Gene ID	6396
Unigene ID	Hs.166924
Probe set ID	207707_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000157020
GTEx ID	ENSG00000157020

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_024206
ラット[1]	NM_001006978

染色体

3p25.3 [10,334,815 - 10,362,862]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001680	WD40 repeat
IPR019782	WD40 repeat 2
IPR019781	WD40 repeat, subgroup
IPR011046	WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986	WD40-repeat-containing domain
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0019886	antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
GO:0002474	antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I
GO:0044267	cellular protein metabolic process
GO:0048208	COPII coating of ER-derived vesicle
GO:0006888	ER to Golgi vesicle-mediated transport
GO:0006886	intracellular protein transport
GO:0016044	membrane organization
GO:0000278	mitotic cell cycle
GO:0051028	mRNA transport
GO:0043687	post-translational protein modification
GO:0018279	protein amino acid N-linked glycosylation via asparagine

Cellular Component

GO:0005829	cytosol
GO:0005789	endoplasmic reticulum membrane
GO:0012507	ER to Golgi transport vesicle membrane
GO:0000776	kinetochore
GO:0005635	nuclear envelope
GO:0031080	Nup107-160 complex

Molecular Function

GO:0005515

protein binding

SEC13 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function