SEC13 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

SEC13-related protein, SEC13-like protein 1, SEC13 (S. cerevisiae)-like 1, SEC13L1, D3S1231E, SEC13R, SEC13-like 1 (S. cerevisiae)

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:73.50

小脳:88.20

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:118.60

目:70.50

動脈:209.80

静脈:133.30

リンパ節:50.60

末梢血:127.50

脾臓:56.70

胸腺:38.70

骨髄:177.10

脂肪:201.70

骨:76.80

皮膚:259.20

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.48

小脳:-

脳幹:3.55

脳梁:3.60

松果体:3.21

末梢神経:-

脊柱:3.27

網膜:-

目:-

動脈:3.99

静脈:3.68

リンパ節:3.62

末梢血:-

脾臓:3.66

胸腺:3.66

骨髄:-

脂肪:3.71

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.12

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.36

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:82

胎盤:109.30

前立腺:56.30

卵巣:37.30

精巣:73.50

心臓:102.20

骨格筋:40.20

食道:-

胃:85

腸:129.60

結腸:93.30

肝臓:84.40

肺:92.90

膀胱:251.20

腎臓:114.40

下垂体:347.90

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:142.30

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:3.81

胎盤:4.16

前立腺:3.61

卵巣:3.67

精巣:3.90

心臓:3.63

骨格筋:3.72

食道:3.71

胃:-

腸:4.49

結腸:4.25

肝臓:4.36

肺:3.80

膀胱:3.65

腎臓:3.92

下垂体:4.39

甲状腺:4.03

副腎:-

膵臓:4.58

乳腺:3.69

唾液腺:4.55

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.19

卵巣:0.09

精巣:0.57

心臓:0.07

骨格筋:1.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0.21

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.19

下垂体:-

甲状腺:0.35

副腎:0.32

膵臓:-

乳腺:0.43

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NR_024272
Gene ID	6396
Unigene ID	Hs.166924
Probe set ID	-
Ensembl ID	-
GTEx ID	-

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]
ラット [0]

染色体

3p25.3 [10,334,815 - 10,362,862]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001680	WD40 repeat
IPR019782	WD40 repeat 2
IPR019781	WD40 repeat, subgroup
IPR011046	WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986	WD40-repeat-containing domain
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0019886	antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
GO:0002474	antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I
GO:0044267	cellular protein metabolic process
GO:0048208	COPII coating of ER-derived vesicle
GO:0006888	ER to Golgi vesicle-mediated transport
GO:0006886	intracellular protein transport
GO:0016044	membrane organization
GO:0000278	mitotic cell cycle
GO:0051028	mRNA transport
GO:0043687	post-translational protein modification
GO:0018279	protein amino acid N-linked glycosylation via asparagine

Cellular Component

GO:0005829	cytosol
GO:0005789	endoplasmic reticulum membrane
GO:0012507	ER to Golgi transport vesicle membrane
GO:0000776	kinetochore
GO:0005635	nuclear envelope
GO:0031080	Nup107-160 complex

Molecular Function

GO:0005515

protein binding