SET nuclear oncogene

同義遺伝子名

SET, Phosphatase 2A inhibitor I2PP2A, Template-activating factor I, I2PP2A, Protein SET, 2PP2A, TAF-I, IGAAD, Inhibitor of granzyme A-activated DNase, TAF-IBETA, HLA-DR-associated protein II, PHAPII, SET translocation (myeloid leukemia-associated), I-2PP2A

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:14.40

GeneChip

大脳:9.83

小脳:9.74

脳幹:9.58

脳梁:10.16

松果体:-

末梢神経:9.58

脊柱:9.95

網膜:-

目:-

動脈:9.69

静脈:9.81

リンパ節:10.15

末梢血:-

脾臓:10.15

胸腺:10.30

骨髄:9.68

脂肪:9.47

骨:-

皮膚:9.71

CAGE

大脳:5.32

小脳:-

脳幹:5.37

脳梁:5.48

松果体:5.60

末梢神経:-

脊柱:5.35

網膜:-

目:-

動脈:4.98

静脈:5.35

リンパ節:5.32

末梢血:-

脾臓:5.56

胸腺:6.31

骨髄:-

脂肪:5.20

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.66

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.34

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.82

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:3.60

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:10.60

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:10.03

胎盤:9.50

前立腺:9.91

卵巣:10.25

精巣:9.55

心臓:9.65

骨格筋:9.16

食道:9.94

胃:9.80

腸:9.68

結腸:9.69

肝臓:9.47

肺:9.78

膀胱:-

腎臓:9.81

下垂体:9.84

甲状腺:10.25

副腎:9.78

膵臓:9.78

乳腺:9.91

唾液腺:9.72

CAGE

子宮:5.52

胎盤:5.46

前立腺:5.57

卵巣:5.78

精巣:5.17

心臓:5.49

骨格筋:5.22

食道:5.59

胃:-

腸:5.18

結腸:5.12

肝臓:5.33

肺:5.19

膀胱:5.74

腎臓:5.30

下垂体:5.14

甲状腺:5.55

副腎:-

膵臓:5.44

乳腺:5.04

唾液腺:5.15

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.64

卵巣:1.73

精巣:1.63

心臓:0.94

骨格筋:0.71

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.22

肝臓:0.73

肺:1.04

膀胱:-

腎臓:2.07

下垂体:-

甲状腺:2.13

副腎:2.50

膵臓:-

乳腺:1.28

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001122821
Gene ID	6418
Unigene ID	Hs.609454
Probe set ID	200630_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000119335
GTEx ID	ENSG00000119335

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]	NM_001008551, NM_001204875, NM_023871
ラット [0]

染色体

9q34.11 [131,445,703 - 131,458,679]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006260	DNA replication
GO:0010467	gene expression
GO:0016071	mRNA metabolic process
GO:0035067	negative regulation of histone acetylation
GO:0043524	negative regulation of neuron apoptosis
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006913	nucleocytoplasmic transport
GO:0006334	nucleosome assembly
GO:0006337	nucleosome disassembly
GO:0016070	RNA metabolic process

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005783	endoplasmic reticulum
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0048471	perinuclear region of cytoplasm
GO:0043234	protein complex

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0042393	histone binding
GO:0004864	phosphoprotein phosphatase inhibitor activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008601	protein phosphatase type 2A regulator activity

SET nuclear oncogene

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function