splicing factor proline/glutamine-rich (polypyrimidine tract binding protein associated)

同義遺伝子名

POMP100, SFPQ, PTB-associated-splicing factor, DNA-binding p52/p100 complex, 100 kDa subunit, hPOMp100, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, 100 kDa DNA-pairing protein

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:162.40

小脳:63

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:148.30

末梢神経:337.40

脊柱:224.60

網膜:118.60

目:146.90

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:262.90

末梢血:54.70

脾臓:56.70

胸腺:141.70

骨髄:472.30

脂肪:121

骨:64

皮膚:326.40

GeneChip

大脳:7.85

小脳:8.14

脳幹:7.70

脳梁:8.40

松果体:-

末梢神経:8.11

脊柱:8.18

網膜:-

目:-

動脈:7.77

静脈:7.82

リンパ節:8.73

末梢血:-

脾臓:8.67

胸腺:9.97

骨髄:8.56

脂肪:8.22

骨:-

皮膚:8.44

CAGE

大脳:5.84

小脳:-

脳幹:5.64

脳梁:5.95

松果体:6.12

末梢神経:-

脊柱:5.92

網膜:-

目:-

動脈:6.10

静脈:5.90

リンパ節:6.17

末梢血:-

脾臓:5.99

胸腺:6.65

骨髄:-

脂肪:5.76

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:5.18

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.84

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.42

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:182.30

胎盤:138.40

前立腺:157.70

卵巣:37.30

精巣:112.50

心臓:357.60

骨格筋:40.20

食道:-

胃:424.80

腸:97.20

結腸:245.90

肝臓:232.20

肺:132

膀胱:125.60

腎臓:187.10

下垂体:347.90

甲状腺:-

副腎:304.70

膵臓:213.40

乳腺:473.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.68

胎盤:8.74

前立腺:8.89

卵巣:8.80

精巣:8.59

心臓:7.77

骨格筋:7.44

食道:8.53

胃:8.28

腸:8.10

結腸:8.35

肝臓:7.69

肺:8.66

膀胱:-

腎臓:8.16

下垂体:7.67

甲状腺:8.28

副腎:8.31

膵臓:7.41

乳腺:8.60

唾液腺:8

CAGE

子宮:5.96

胎盤:5.77

前立腺:5.93

卵巣:6.02

精巣:6.01

心臓:5.91

骨格筋:5.65

食道:5.61

胃:-

腸:5.76

結腸:5.92

肝臓:5.54

肺:5.99

膀胱:5.68

腎臓:5.84

下垂体:5.90

甲状腺:5.47

副腎:-

膵臓:5.47

乳腺:6.22

唾液腺:5.71

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.83

卵巣:6.75

精巣:6.55

心臓:4.62

骨格筋:5.40

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.02

肝臓:4.13

肺:4.49

膀胱:-

腎臓:6.04

下垂体:-

甲状腺:6.17

副腎:5.99

膵臓:-

乳腺:5.60

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005066
Gene ID	6421
Unigene ID	Hs.355934
Probe set ID	201586_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000116560
GTEx ID	ENSG00000116560

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_023603
ラット[2]	NM_001025271

染色体

1p34.3 [35,641,979 - 35,658,749]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000380	alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0006310	DNA recombination
GO:0006281	DNA repair
GO:0006397	mRNA processing
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0008380	RNA splicing
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0016363	nuclear matrix
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0042382	paraspeckles

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

splicing factor proline/glutamine-rich (polypyrimidine tract binding protein associated)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function