splicing factor, arginine/serine-rich 1

同義遺伝子名

SF2, SFRS1, OK/SW-cl.3, Alternative-splicing factor 1, Splicing factor, arginine/serine-rich 1, pre-mRNA-splicing factor SF2, P33 subunit, ASF-1, SRp30a, SF2P33

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:282.10

小脳:214.10

脳幹:-

脳梁:379.10

松果体:-

末梢神経:214.70

脊柱:112.30

網膜:355.90

目:182.20

動脈:539.60

静脈:-

リンパ節:262.90

末梢血:127.50

脾臓:302.50

胸腺:1004.90

骨髄:39.40

脂肪:161.30

骨:153.50

皮膚:153.60

GeneChip

大脳:8.34

小脳:8.82

脳幹:8.44

脳梁:8.77

松果体:-

末梢神経:8.29

脊柱:8.40

網膜:-

目:-

動脈:8.78

静脈:8.56

リンパ節:9.41

末梢血:-

脾臓:9.40

胸腺:10.20

骨髄:9.01

脂肪:8.58

骨:-

皮膚:9.09

CAGE

大脳:4.46

小脳:-

脳幹:4.43

脳梁:4.35

松果体:4.71

末梢神経:-

脊柱:4.53

網膜:-

目:-

動脈:4.58

静脈:4.52

リンパ節:4.60

末梢血:-

脾臓:4.41

胸腺:4.92

骨髄:-

脂肪:4.36

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.48

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.48

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.10

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:391.90

胎盤:138.40

前立腺:146.40

卵巣:111.80

精巣:203.30

心臓:229.90

骨格筋:60.30

食道:-

胃:85

腸:486

結腸:144.20

肝臓:158.30

肺:190.60

膀胱:1256.10

腎臓:207.90

下垂体:232

甲状腺:163.70

副腎:304.70

膵臓:142.30

乳腺:213.70

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:9.46

胎盤:8.70

前立腺:9.65

卵巣:9.33

精巣:8.69

心臓:8.68

骨格筋:8.43

食道:9.03

胃:9.11

腸:8.77

結腸:8.78

肝臓:8.68

肺:9

膀胱:-

腎臓:8.68

下垂体:8.75

甲状腺:9.33

副腎:9.34

膵臓:7.67

乳腺:8.94

唾液腺:8.90

CAGE

子宮:4.47

胎盤:4.25

前立腺:4.31

卵巣:4.28

精巣:4.28

心臓:4.24

骨格筋:4.46

食道:4.26

胃:-

腸:4.27

結腸:4.63

肝臓:4.36

肺:4.31

膀胱:4.23

腎臓:4.36

下垂体:4.68

甲状腺:4.27

副腎:-

膵臓:4.39

乳腺:4.45

唾液腺:4.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.79

卵巣:2.22

精巣:1.50

心臓:1.19

骨格筋:0.58

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.93

肝臓:0.63

肺:3.18

膀胱:-

腎臓:2.03

下垂体:-

甲状腺:2.16

副腎:2.81

膵臓:-

乳腺:1.57

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001078166
Gene ID	6426
Unigene ID	Hs.68714
Probe set ID	211784_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000136450
GTEx ID	ENSG00000136450

オーソログ対応遺伝子

マウス[12]	NM_001078167, NM_173374
ラット[1]	NM_001109552, NM_173374

染色体

17q22 [56,078,284 - 56,084,707]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

GO:0060048	cardiac muscle contraction
GO:0010467	gene expression
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0031124	mRNA 3'-end processing
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0006397	mRNA processing
GO:0006376	mRNA splice site selection
GO:0000395	nuclear mRNA 5'-splice site recognition
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing
GO:0006369	termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005654	nucleoplasm

GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding
GO:0050733	RS domain binding

splicing factor, arginine/serine-rich 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function