transformer 2 beta homolog (Drosophila)

同義遺伝子名

Transformer-2-beta, Arginine/serine-rich-splicing factor 10, TRA2B, Htra2-beta, DKFZp686F18120, TRA2-BETA, Transformer 2 protein homolog, HTRA2-beta, SRFS10, SFRS10

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:101.90

小脳:125.90

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:296.70

末梢神経:245.40

脊柱:-

網膜:-

目:135.20

動脈:149.90

静脈:-

リンパ節:212.30

末梢血:109.30

脾臓:226.90

胸腺:360.70

骨髄:157.40

脂肪:121

骨:243.10

皮膚:144

GeneChip

大脳:4.21

小脳:4.53

脳幹:4.13

脳梁:4.33

松果体:-

末梢神経:5.37

脊柱:4.57

網膜:-

目:-

動脈:5.87

静脈:5.95

リンパ節:5.82

末梢血:-

脾臓:6.04

胸腺:6.71

骨髄:5.46

脂肪:5.44

骨:-

皮膚:5.73

CAGE

大脳:4.18

小脳:-

脳幹:4.15

脳梁:4.04

松果体:4.42

末梢神経:-

脊柱:4.22

網膜:-

目:-

動脈:4.78

静脈:4.62

リンパ節:4.58

末梢血:-

脾臓:4.24

胸腺:4.84

骨髄:-

脂肪:4.33

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.96

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.56

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.95

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:182.30

胎盤:189.40

前立腺:123.90

卵巣:186.30

精巣:160.10

心臓:140.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:85

腸:712.80

結腸:25.40

肝臓:95

肺:176

膀胱:376.80

腎臓:145.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:304.70

膵臓:124.50

乳腺:111.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.04

胎盤:5.17

前立腺:6.13

卵巣:5.74

精巣:6.08

心臓:5

骨格筋:4.74

食道:5.90

胃:5.05

腸:4.71

結腸:4.73

肝臓:4.78

肺:5.94

膀胱:-

腎臓:4.58

下垂体:4.90

甲状腺:5.95

副腎:5.26

膵臓:4.27

乳腺:5.95

唾液腺:4.87

CAGE

子宮:4.61

胎盤:4.54

前立腺:4.50

卵巣:4.36

精巣:4.60

心臓:4.42

骨格筋:4.73

食道:4.32

胃:-

腸:4.15

結腸:4.42

肝臓:4.16

肺:4.55

膀胱:4.53

腎臓:4.09

下垂体:4.44

甲状腺:4.30

副腎:-

膵臓:4.35

乳腺:4.61

唾液腺:4.22

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.86

卵巣:4.81

精巣:4.81

心臓:3.14

骨格筋:3.55

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.23

肝臓:3.70

肺:4.34

膀胱:-

腎臓:4.68

下垂体:-

甲状腺:4.93

副腎:4.44

膵臓:-

乳腺:4.43

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_004593
Gene ID	6434
Unigene ID	Hs.533122
Probe set ID	210180_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000136527
GTEx ID	ENSG00000136527

オーソログ対応遺伝子

マウス[8]	NM_009186
ラット[8]	NM_009186

染色体

3q27.2 [185,633,694 - 185,655,924]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0048026	positive regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000381	regulation of alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000375	RNA splicing, via transesterification reactions

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0003729	mRNA binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding

transformer 2 beta homolog (Drosophila)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function