sarcoglycan, alpha (50kDa dystrophin-associated glycoprotein)

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

DAG2, 50kD DAG, 50DAG, Adhalin, A2, LGMD2D, Alpha-SG, DMDA2, ADL, SGCA, 50 kDa dystrophin-associated glycoprotein, 50-DAG, adhalin, Dystroglycan 2, SCARMD1, Alpha-sarcoglycan precursor

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:3.60 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:35.30 動脈:- 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:80.70 骨:25.60 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.25 小脳:4.57 脳幹:4.35 脳梁:4.18 松果体:- 末梢神経:4.07 脊柱:4.03 網膜:- 目:- 動脈:6.41 静脈:6.50 リンパ節:4.28 末梢血:- 脾臓:4.03 胸腺:3.92 骨髄:4.20 脂肪:4.58 骨:- 皮膚:5
CAGE 大脳:0.87 小脳:- 脳幹:0.86 脳梁:0.70 松果体:3.56 末梢神経:- 脊柱:0.82 網膜:- 目:- 動脈:5.35 静脈:3.05 リンパ節:1.53 末梢血:- 脾臓:0.61 胸腺:0.64 骨髄:- 脂肪:2.52 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.65 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.63 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:7.30 前立腺:33.80 卵巣:74.50 精巣:8.70 心臓:38.30 骨格筋:361.60 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.65 胎盤:4.30 前立腺:4.44 卵巣:4.36 精巣:4.72 心臓:6.05 骨格筋:7.89 食道:5.49 胃:4.77 腸:5.21 結腸:4.90 肝臓:4.33 肺:5.05 膀胱:- 腎臓:4.25 下垂体:4.02 甲状腺:4.18 副腎:4.26 膵臓:4.74 乳腺:4.47 唾液腺:4.55
CAGE 子宮:3.43 胎盤:1.63 前立腺:3.85 卵巣:2.70 精巣:1.48 心臓:4.70 骨格筋:6.22 食道:3.78 胃:- 腸:2.47 結腸:3.22     肝臓:1.57    肺:3.08 膀胱:4.37 腎臓:1.24 下垂体:0.19 甲状腺:2.00 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:1.16 唾液腺:1.15
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.28 卵巣:0.53 精巣:2.09 心臓:3.21 骨格筋:5.60 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.37     肝臓:0.06        肺:2.10    膀胱:- 腎臓:0.29 下垂体:- 甲状腺:2.05 副腎:1.89 膵臓:- 乳腺:1.22 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001135697
Gene ID 6442
Unigene ID Hs.463412
Probe set ID 210632_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000108823
GTEx ID ENSG00000108823

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001136080, NM_009161
ラット[1]  NM_001107039, NM_009161

染色体

17q21.33  [48,241,575  -  48,253,292]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015919  Cadherin-like
IPR006644  Dystroglycan-type cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7657792
7663524
7744812
7937874
8069911
8226900
8528203
8681137
9032047
9192266
9585331
9864373
10684260
10767327
10993904
11747090
12477932
15298081
15489334
15954112
16883602
18078839
18996010
20019182
20301582
21031578
21361872
21656825
21856579
21884196
22303798
23703062
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006936  muscle contraction
GO:0007517  muscle organ development

Cellular Component

GO:0005911  cell-cell junction
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0016010  dystrophin-associated glycoprotein complex
GO:0016021  integral to membrane
GO:0045121  membrane raft
GO:0016012  sarcoglycan complex
GO:0042383  sarcolemma

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding