SIX homeobox 1

同義遺伝子名

sine oculis homeobox (Drosophila) homolog 1, Sine oculis homeobox homolog 1, BOS3, sine oculis homeobox homolog 1 (Drosophila), Homeobox protein SIX1, SIX1, DFNA23

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.67

小脳:4.82

脳幹:4.75

脳梁:4.72

松果体:-

末梢神経:5.47

脊柱:4.65

網膜:-

目:-

動脈:4.76

静脈:5.25

リンパ節:4.71

末梢血:-

脾臓:4.45

胸腺:5.12

骨髄:4.56

脂肪:5.48

骨:-

皮膚:5.22

CAGE

大脳:0.36

小脳:-

脳幹:1.02

脳梁:0.99

松果体:0.71

末梢神経:-

脊柱:0.92

網膜:-

目:-

動脈:2.84

静脈:3.18

リンパ節:1.46

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:2.73

骨髄:-

脂肪:3.05

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.32

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.48

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.96

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:4.56

胎盤:4.44

前立腺:6.31

卵巣:4.62

精巣:4.82

心臓:4.84

骨格筋:7.65

食道:5.53

胃:4.57

腸:5.38

結腸:4.76

肝臓:4.61

肺:4.76

膀胱:-

腎臓:4.68

下垂体:6.94

甲状腺:4.81

副腎:4.82

膵臓:5.03

乳腺:4.63

唾液腺:7.79

CAGE

子宮:1.52

胎盤:0

前立腺:3.26

卵巣:0.56

精巣:1.91

心臓:0.62

骨格筋:4.67

食道:1.66

胃:-

腸:0

結腸:0.15

肝臓:0

肺:2.08

膀胱:1.76

腎臓:0.21

下垂体:4.47

甲状腺:2.06

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:2.74

唾液腺:5.13

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.65

卵巣:0.21

精巣:2.83

心臓:0.05

骨格筋:5.10

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.05

肝臓:0

肺:2.64

膀胱:-

腎臓:0.15

下垂体:-

甲状腺:2.81

副腎:0.33

膵臓:-

乳腺:3.01

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005982
Gene ID	6495
Unigene ID	-
Probe set ID	205817_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000126778
GTEx ID	ENSG00000126778

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009189
ラット[1]	NM_053759

染色体

14q23.1 [61,111,415 - 61,124,977]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006915	apoptosis
GO:0001658	branching involved in ureteric bud morphogenesis
GO:0090103	cochlea morphogenesis
GO:0048701	embryonic cranial skeleton morphogenesis
GO:0048704	embryonic skeletal system morphogenesis
GO:0030855	epithelial cell differentiation
GO:0021610	facial nerve morphogenesis
GO:0048699	generation of neurons
GO:0001759	induction of an organ
GO:0048839	inner ear development
GO:0042472	inner ear morphogenesis
GO:0001822	kidney development
GO:0042474	middle ear morphogenesis
GO:0051451	myoblast migration
GO:0090191	negative regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis
GO:0043524	negative regulation of neuron apoptosis
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0048665	neuron fate specification
GO:0003151	outflow tract morphogenesis
GO:0007389	pattern specification process
GO:0060037	pharyngeal system development
GO:0090190	positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0034504	protein localization in nucleus
GO:0045664	regulation of neuron differentiation
GO:0032880	regulation of protein localization
GO:0008582	regulation of synaptic growth at neuromuscular junction
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007605	sensory perception of sound
GO:0007519	skeletal muscle tissue development
GO:0048538	thymus development
GO:0030878	thyroid gland development
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0001657	ureteric bud development

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity

SIX homeobox 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function