UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (yeast)

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

Up-frameshift suppressor 3 homolog A, Regulator of nonsense transcripts 3A, UPF3A, Nonsense mRNA reducing factor 3A, HUPF3A, UPF3, RENT3A, hUpf3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:36.70 小脳:63 脳幹:- 脳梁:- 松果体:296.70 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:76.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:101.10 末梢血:- 脾臓:56.70 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:76.80 皮膚:91.20
GeneChip 大脳:8.29 小脳:8.82 脳幹:8.46 脳梁:8.94 松果体:- 末梢神経:7.75 脊柱:8.77 網膜:- 目:- 動脈:7.72 静脈:7.49 リンパ節:8.36 末梢血:- 脾臓:8.34 胸腺:9.08 骨髄:7.31 脂肪:8.10 骨:- 皮膚:7.87
CAGE 大脳:2.87 小脳:- 脳幹:2.89 脳梁:2.88 松果体:2.90 末梢神経:- 脊柱:2.74 網膜:- 目:- 動脈:2.00 静脈:2.27 リンパ節:1.96 末梢血:- 脾臓:1.83 胸腺:2.18 骨髄:- 脂肪:1.57 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.69 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.66 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.99 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:43.70 前立腺:78.90 卵巣:37.30 精巣:151.40 心臓:76.60 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:64.80 結腸:42.40     肝臓:42.20        肺:68.40    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:71.10 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.53 胎盤:7.77 前立腺:8.56 卵巣:8.39 精巣:9.56 心臓:7.11 骨格筋:7.61 食道:8.04 胃:8.03 腸:7.53 結腸:6.80 肝臓:7.84 肺:7.83 膀胱:- 腎臓:7.72 下垂体:8.23 甲状腺:9.16 副腎:8.13 膵臓:7.23 乳腺:8.05 唾液腺:7.28
CAGE 子宮:2.35 胎盤:2.05 前立腺:2.22 卵巣:2.17 精巣:2.92 心臓:1.86 骨格筋:2.25 食道:1.80 胃:- 腸:1.90 結腸:2.20     肝臓:1.37    肺:1.89 膀胱:1.76 腎臓:2.07 下垂体:2.22 甲状腺:2.49 副腎:- 膵臓:1.98 乳腺:2.34 唾液腺:1.82
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.30 卵巣:3.04 精巣:4.57 心臓:1.64 骨格筋:1.28 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.45     肝臓:1.79        肺:2.33    膀胱:- 腎臓:2.49 下垂体:- 甲状腺:3.82 副腎:3.46 膵臓:- 乳腺:3.29 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_023011
Gene ID 65110
Unigene ID Hs.533855
Probe set ID 214323_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000169062
GTEx ID ENSG00000169062

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_025924
ラット[1]  NM_001012159

染色体

13q34  [115,047,059  -  115,071,283]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11113196
11163187
11544179
11546873
11546874
12417715
12477932
12554878
12723973
14527413
14636577
14702039
15004547
15057823
15231747
15489334
16169070
16452507
16601204
17704778
17803295
17803942
18029348
19503078
21145460
21832049
23275563

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0051028  mRNA transport
GO:0000184  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0006913  nucleocytoplasmic transport
GO:0045727  positive regulation of translation
GO:0016070  RNA metabolic process

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0035145  exon-exon junction complex
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005487  nucleocytoplasmic transporter activity
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding