smoothelin

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同義遺伝子名

FLJ38597, smoothelin, SMSMO, Smoothelin, SMTN, FLJ35365

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:92.40

小脳:516.30

脳幹:-

脳梁:116.60

松果体:-

末梢神経:122.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:82.30

動脈:89.90

静脈:66.60

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:340.30

胸腺:386.50

骨髄:59

脂肪:403.30

骨:140.70

皮膚:100.80

GeneChip

大脳:5.25

小脳:5.63

脳幹:5.48

脳梁:5.04

松果体:-

末梢神経:8.06

脊柱:5.38

網膜:-

目:-

動脈:9.24

静脈:9.10

リンパ節:5.94

末梢血:-

脾臓:6.95

胸腺:4.63

骨髄:5.36

脂肪:7.09

骨:-

皮膚:7.04

CAGE

大脳:2.55

小脳:-

脳幹:2.70

脳梁:2.33

松果体:2.54

末梢神経:-

脊柱:2.18

網膜:-

目:-

動脈:5.70

静脈:4.07

リンパ節:2.31

末梢血:-

脾臓:4.18

胸腺:2.05

骨髄:-

脂肪:4.33

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.06

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:2168.90

胎盤:131.10

前立腺:360.50

卵巣:447.20

精巣:177.40

心臓:395.90

骨格筋:180.80

食道:3085.40

胃:616

腸:1328.30

結腸:398.50

肝臓:42.20

肺:200.40

膀胱:-

腎臓:72.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:152.40

膵臓:-

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.63

胎盤:5.87

前立腺:8.43

卵巣:6.96

精巣:5.76

心臓:7.99

骨格筋:7.09

食道:7.44

胃:8.94

腸:8.61

結腸:9.07

肝臓:5.84

肺:6.72

膀胱:-

腎臓:6.59

下垂体:5.49

甲状腺:6.16

副腎:7.02

膵臓:5.89

乳腺:7.66

唾液腺:5.46

CAGE

子宮:5.76

胎盤:3.13

前立腺:6.20

卵巣:4.50

精巣:3.61

心臓:4.70

骨格筋:4.04

食道:6.30

胃:-

腸:4.87

結腸:6.00

肝臓:2.84

肺:3.59

膀胱:6.63

腎臓:3.38

下垂体:1.94

甲状腺:3.02

副腎:-

膵臓:3.26

乳腺:4.00

唾液腺:2.66

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.08

卵巣:0.02

精巣:0.00

心臓:0

骨格筋:0.16

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.02

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.01

副腎:0.00

膵臓:-

乳腺:0.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_134270
Gene ID	6525
Unigene ID	Hs.149098
Probe set ID	207390_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000183963
GTEx ID	ENSG00000183963

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001159284, NM_013870
ラット[1]	NM_001013049, NM_013870

染色体

22q12.2 [31,460,091 - 31,500,610]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016146	Calponin-homology
IPR001715	Calponin-like actin-binding

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007517	muscle organ development
GO:0006939	smooth muscle contraction

Cellular Component

GO:0015629	actin cytoskeleton
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005856	cytoskeleton

Molecular Function

GO:0003779	actin binding
GO:0008307	structural constituent of muscle