solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 1

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同義遺伝子名

SLC6A1, GABATR, GABATHG, GABT1, GAT1, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:112.60

小脳:88.20

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:11.80

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:9.22

小脳:8.87

脳幹:8.86

脳梁:8.98

松果体:-

末梢神経:5.40

脊柱:8.82

網膜:-

目:-

動脈:4.23

静脈:4.56

リンパ節:3.85

末梢血:-

脾臓:3.87

胸腺:6.95

骨髄:4.01

脂肪:4.20

骨:-

皮膚:3.79

CAGE

大脳:4.89

小脳:-

脳幹:4.55

脳梁:5.06

松果体:2.47

末梢神経:-

脊柱:4.42

網膜:-

目:-

動脈:1.68

静脈:2.25

リンパ節:0.84

末梢血:-

脾臓:0.84

胸腺:2.07

骨髄:-

脂肪:0.26

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:5.53

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.26

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.20

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:8.50

肝臓:21.10

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4

胎盤:4.18

前立腺:3.91

卵巣:3.57

精巣:5.38

心臓:4.60

骨格筋:4.70

食道:4.41

胃:4.20

腸:3.84

結腸:4.65

肝臓:9.39

肺:4.09

膀胱:-

腎臓:4.58

下垂体:4.45

甲状腺:3.48

副腎:4.38

膵臓:3.59

乳腺:3.80

唾液腺:3.95

CAGE

子宮:1.32

胎盤:0.16

前立腺:0.97

卵巣:1.39

精巣:1.25

心臓:1.30

骨格筋:0.52

食道:2.38

胃:-

腸:0.14

結腸:0.21

肝臓:4.11

肺:0.54

膀胱:0.83

腎臓:0.44

下垂体:1.24

甲状腺:0.23

副腎:-

膵臓:0.94

乳腺:0.55

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.77

卵巣:1.25

精巣:1.60

心臓:0.49

骨格筋:0.15

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.25

肝臓:3.44

肺:0.71

膀胱:-

腎臓:0.54

下垂体:-

甲状腺:0.23

副腎:0.30

膵臓:-

乳腺:0.63

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003042
Gene ID	6529
Unigene ID	Hs.443874
Probe set ID	205152_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000157103
GTEx ID	ENSG00000157103

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_178703
ラット [0]

染色体

3p25.3 [11,034,410 - 11,080,933]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000175	Sodium:neurotransmitter symporter
IPR002980	Sodium:neurotransmitter symporter, GABA, GAT-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0051939	gamma-aminobutyric acid import
GO:0007612	learning
GO:0032229	negative regulation of synaptic transmission, GABAergic
GO:0007269	neurotransmitter secretion
GO:0014054	positive regulation of gamma-aminobutyric acid secretion
GO:0051260	protein homooligomerization
GO:0051592	response to calcium ion
GO:0042220	response to cocaine
GO:0032355	response to estradiol stimulus
GO:0010288	response to lead ion
GO:0014074	response to purine
GO:0009744	response to sucrose stimulus
GO:0009636	response to toxin
GO:0007268	synaptic transmission
GO:0055085	transmembrane transport
GO:0006810	transport

Cellular Component

GO:0030424	axon
GO:0009986	cell surface
GO:0016021	integral to membrane
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0016020	membrane
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0005332	gamma-aminobutyric acid:sodium symporter activity
GO:0005328	neurotransmitter:sodium symporter activity

solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function