solute carrier family 11 (proton-coupled divalent metal ion transporters), member 1

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同義遺伝子名

SLC11A1, NRAMP1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, NRAMP 1, NRAMP, LSH

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:8.30

小脳:50.40

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:41.10

動脈:-

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:364.40

脾臓:132.30

胸腺:12.90

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:51.20

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:4.21

小脳:4.22

脳幹:4.35

脳梁:4.15

松果体:-

末梢神経:4.01

脊柱:4.02

網膜:-

目:-

動脈:4.03

静脈:4.40

リンパ節:4.06

末梢血:-

脾臓:4.03

胸腺:4.09

骨髄:4.56

脂肪:4.25

骨:-

皮膚:4.58

CAGE

大脳:2.61

小脳:-

脳幹:3.22

脳梁:2.70

松果体:2.94

末梢神経:-

脊柱:4.13

網膜:-

目:-

動脈:2.62

静脈:1.53

リンパ節:2.55

末梢血:-

脾臓:3.81

胸腺:0.71

骨髄:-

脂肪:3.72

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.51

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.46

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.67

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:36.50

胎盤:40.10

前立腺:-

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:33.90

肝臓:-

肺:127.10

膀胱:125.60

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:-

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.02

胎盤:4.06

前立腺:3.97

卵巣:4.08

精巣:4.04

心臓:4.45

骨格筋:4.53

食道:4.07

胃:4.08

腸:4.19

結腸:4.39

肝臓:4.10

肺:5.85

膀胱:-

腎臓:4.18

下垂体:3.99

甲状腺:3.77

副腎:4.13

膵臓:4.34

乳腺:3.85

唾液腺:4.21

CAGE

子宮:1.10

胎盤:2.20

前立腺:1.42

卵巣:2.18

精巣:1.38

心臓:2.22

骨格筋:1.97

食道:1.62

胃:-

腸:0.99

結腸:0.82

肝臓:1.79

肺:4.72

膀胱:3.07

腎臓:2.07

下垂体:1.96

甲状腺:1.48

副腎:-

膵臓:1.98

乳腺:1.92

唾液腺:0.83

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.83

卵巣:0.41

精巣:0.49

心臓:0.59

骨格筋:0.19

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.64

肝臓:0.96

肺:3.56

膀胱:-

腎臓:0.92

下垂体:-

甲状腺:0.75

副腎:0.67

膵臓:-

乳腺:0.45

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000578
Gene ID	6556
Unigene ID	Hs.591607
Probe set ID	217507_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000018280
GTEx ID	ENSG00000018280

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_013612
ラット[1]	NM_001031658

染色体

2q35 [219,246,752 - 219,261,617]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001046

Natural resistance-associated macrophage protein

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0032147	activation of protein kinase activity
GO:0048002	antigen processing and presentation of peptide antigen
GO:0070574	cadmium ion transmembrane transport
GO:0006876	cellular cadmium ion homeostasis
GO:0006879	cellular iron ion homeostasis
GO:0042742	defense response to bacterium
GO:0050829	defense response to Gram-negative bacterium
GO:0042832	defense response to protozoan
GO:0070839	divalent metal ion export
GO:0006954	inflammatory response
GO:0051701	interaction with host
GO:0032623	interleukin-2 production
GO:0032632	interleukin-3 production
GO:0055072	iron ion homeostasis
GO:0006826	iron ion transport
GO:0043091	L-arginine import
GO:0042116	macrophage activation
GO:0006828	manganese ion transport
GO:0045342	MHC class II biosynthetic process
GO:0048255	mRNA stabilization
GO:0060586	multicellular organismal iron ion homeostasis
GO:0001818	negative regulation of cytokine production
GO:0015707	nitrite transport
GO:0006909	phagocytosis
GO:0001819	positive regulation of cytokine production
GO:0002606	positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation
GO:0010628	positive regulation of gene expression
GO:0032729	positive regulation of interferon-gamma production
GO:0050766	positive regulation of phagocytosis
GO:0002827	positive regulation of T-helper 1 type immune response
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0000060	protein import into nucleus, translocation
GO:0045730	respiratory burst
GO:0009617	response to bacterium
GO:0034341	response to interferon-gamma
GO:0032496	response to lipopolysaccharide
GO:0002369	T cell cytokine production
GO:0002309	T cell proliferation during immune response
GO:0055085	transmembrane transport
GO:0007035	vacuolar acidification
GO:0042060	wound healing

Cellular Component

GO:0009279	cell outer membrane
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0005770	late endosome
GO:0031902	late endosome membrane
GO:0005764	lysosome
GO:0030670	phagocytic vesicle membrane
GO:0005886	plasma membrane
GO:0070821	tertiary granule membrane

Molecular Function

GO:0005384	manganese ion transmembrane transporter activity
GO:0051139	metal ion:hydrogen antiporter activity
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0046915	transition metal ion transmembrane transporter activity

solute carrier family 11 (proton-coupled divalent metal ion transporters), member 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function