slit homolog 1 (Drosophila)

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同義遺伝子名

KIAA0813, slit1, slit (Drosophila) homolog 1, SLIT1, SLIL1, MEGF4, Multiple epidermal growth factor-like domains 4, Slit homolog 1 protein precursor, Slit-1, SLIT3, slit homolog 1 (Drosophila)

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:116.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:35.30 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:90.20 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:3.96 小脳:3.84 脳幹:3.91 脳梁:3.82 松果体:- 末梢神経:3.62 脊柱:3.54 網膜:- 目:- 動脈:3.58 静脈:4.34 リンパ節:3.60 末梢血:- 脾臓:3.45 胸腺:3.64 骨髄:3.82 脂肪:3.80 骨:- 皮膚:3.85
CAGE 大脳:2.39 小脳:- 脳幹:0.80 脳梁:1.29 松果体:0.36 末梢神経:- 脊柱:1.43 網膜:- 目:- 動脈:0 静脈:1.03 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:2.07 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.33 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.11 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.08 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:7.30 前立腺:- 卵巣:- 精巣:21.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:19.60    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.66 胎盤:3.73 前立腺:3.54 卵巣:3.91 精巣:3.64 心臓:3.80 骨格筋:4.18 食道:3.83 胃:3.62 腸:3.83 結腸:3.82 肝臓:3.77 肺:3.83 膀胱:- 腎臓:3.72 下垂体:4.38 甲状腺:3.53 副腎:3.67 膵臓:4.34 乳腺:3.54 唾液腺:3.74
CAGE 子宮:0 胎盤:0 前立腺:0.15 卵巣:0.14 精巣:0.21 心臓:0 骨格筋:0 食道:0 胃:- 腸:0 結腸:0.08     肝臓:0    肺:0 膀胱:0 腎臓:0 下垂体:2.63 甲状腺:0.12 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.16 卵巣:0.17 精巣:0.25 心臓:0.03 骨格筋:0.06 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.15     肝臓:0.03        肺:0.10    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.02 副腎:0.12 膵臓:- 乳腺:0.11 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003061
Gene ID 6585
Unigene ID Hs.632082
Probe set ID 208221_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000187122
GTEx ID ENSG00000187122

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_015748
ラット [0]  

染色体

10q24.1  [98,757,795  -  98,945,683]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008985  Concanavalin A-like lectin/glucanase
IPR013320  Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
IPR006207  Cystine knot, C-terminal
IPR001881  EGF-like calcium-binding
IPR000742  EGF-like, type 3
IPR003645  Follistatin-like, N-terminal
IPR001791  Laminin G

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9693030
9813312
10364234
10432110
10433822
11748139
12107412
12141424
12168954
12200164
12477932
15207848
16162649
16385451
16713569
16840550
17062560
18029348
18829537
23251661
23382691

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048846  axon extension involved in axon guidance
GO:0007411  axon guidance
GO:0021834  chemorepulsion involved in embryonic olfactory bulb interneuron migration
GO:0033563  dorsal/ventral axon guidance
GO:0040023  establishment of nucleus localization
GO:0048853  forebrain morphogenesis
GO:0008045  motor axon guidance
GO:0050919  negative chemotaxis
GO:0048843  negative regulation of axon extension involved in axon guidance
GO:0051964  negative regulation of synaptogenesis
GO:0031290  retinal ganglion cell axon guidance
GO:0021510  spinal cord development

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005615  extracellular space

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding
GO:0043395  heparan sulfate proteoglycan binding
GO:0048495  Roundabout binding